杨树PtPIF和PtPIN1s基因功能的初步分析

来源 :中国林业科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chshlu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
光敏色素相互作用因子(Phytochrome Interacting Factor,PIF)是碱性螺旋-环-螺旋(basic Helix-Loop-Helix,bHLH)转录因子家族的一员,参与了植物光信号传导。拟南芥基因组共编码7个PIFs,在种子萌发、下胚轴伸长、植物蔽荫反应和叶片衰老等过程具有重要功能,通过调控生长素的合成与分布是其影响植物生长发育的重要途径。木本植物具有不同于草本植物的生长发育过程,因此对光信号的应答也存在差异。研究杨树中PIF基因功能有助于揭示树木光信号响应机制。本研究分析了杨树Pt PIF基因家族成员的系统进化关系、基因结构、保守结构域及不同组织和不同胁迫条件下的表达模式。生长素运输载体PIN是植物特有的,细胞膜极性定位的PIN蛋白可能受到PIF调控生长素的运输改变生长素浓度梯度,从而影响植物生长发育。毛果杨共有15个Pt PIN基因,相对于拟南芥发生了显著扩张。为了探究PtPIN1s在表达及功能上的差异,通过GUS染色分析了PtPIN1s的组织表达差异,并分析了PtPIN1s在不同组织和不同胁迫条件下的表达模式。研究结果如下:1.筛选得到10个PtPIF基因家族成员,是拟南芥7个PIF基因家族成员的1.43倍;系统进化分析发现了4个同源基因对(PtPIF3a/PtPIF3b、PtPIF4/5a/PtPIF4/5b、PtPIF8a/PtPIF8b和PtPIF9a/PtPIF9b);PtPIFs的基因结构和蛋白结构域相对保守;且预测PtPIFs基因启动子区包含激素等胁迫响应元件。表明PtPIF能够响应环境因子的变化,比如光。2.PtPIFs基因具有组织表达特异性并能响应多种非生物胁迫。Pt PIF1、PtPIF8a和PtPIF8b主要在成熟叶中表达,PtPIF3a和Pt PIF9b主要在幼叶中表达;低温处理下,PtPIF1、PtPIF4/5a、PtPIF8b和PtPIF9b的表达量下调,PtPIF10上调;干旱处理下,PtPIF3b和PtPIF4/5b的表达量下调,PtPIF8a上调;盐处理下,PtPIF4/5a的表达量下调,PtPIF3b和PtPIF9a上调。表明PtPIFs能够响应不同的环境胁迫。3.为了验证PtPIFs能够与G-box结合,选取PtPIF3a构建至pGADT7-Rec2载体上,将G-box序列与突变了的G-box序列以三次重复方式串联并克隆至pHIS2载体上。酵母单杂交实验结果表明,PtPIF3a能够与G-box结合,而不能与突变了的G-box结合。Pt PIF3a的结合能力表明PtPIFs有可能通过G-box调控PIN。4.根据系统进化分析的结果将PtPIN1s分为两类,一类是PtPIN1a和PtPIN1b,另一类是PtPIN1c和PtPIN1d。GUS染色结果发现,PtPIN1a和PtPIN1b在不定根根尖处的表达强于PtPIN1c和PtPIN1d,这种表达差异产生于不定根形成的愈伤组织阶段,且不受外源生长素影响。在低温、干旱及盐胁迫下,PtPIN1a/Pt PIN1b和Pt PIN1c/PtPIN1d的表达有不同也有相似之处。低温处理下,PtPIN1b的表达量下调,PtPIN1c上调;干旱处理下PtPIN1b和PtPIN1c的表达量上调,PtPIN1d下调;盐处理下,PtPIN1d的表达量下调。PtPIN1s在响应胁迫上的不同,表明木本植物PIN蛋白在进化和功能上的多样化。本研究预测了杨树PtPIF基因家族成员,并对各成员的基因结构、保守结构域进行了系统分析;检测了PtPIF成员在不同组织及低温、干旱和NaCl胁迫下的表达模式。同时,证明了PtPIN1s在不定根形成及不同非生物胁迫下的不同表达模式。PtPIF3a与G-box的结合能力表明PtPIFs有可能与PIN发生相互作用。研究结果为深入探究杨树PtPIF和PtPIN1s在不同环境下调控植物生长发育的作用机制奠定了基础。
其他文献
系统级封装(SIP)是微电子机械系统(MEMS)器件封装的一个良好解决方案。对于具有可动结构的MEMS器件来说,芯片表面产生的应力与变形会对其性能和可靠性产生明显的影响,因此,研
双基合成孔径雷达(Bistatic Synthetic Aperture Radar,Bi-SAR)是指雷达发射机和接收机安置在不同平台上的合成孔径雷达系统,是一种新型体制的合成孔径雷达(SAR)系统。与传统
以高海拔、低温低氧著称的青藏高原生态系统是典型的高寒生态系统。牦牛生活在3200m-5000m海拔的高寒大草原,能够适应-40℃低温和11.44%低氧含量的环境。牦牛在草原生态系统物质循环中具有重要的作用,牦牛产生粪便的分解对青藏高原生态系统也具有重要的生态学意义。严酷的高原环境孕育了丰富、特殊的具有工业及医药方面有潜在应用价值的微生物资源。目前,关于青藏高原牦牛粪降解微生物多样性的研究,未见报道
为了获得更高的定位精度和抗多径性能,伽利略系统采用BOC(二进制偏置载波,Binary Offset Carrier)做为其新的调制方式,BOC信号也是GPS现代化改造中的一个特点。   E1频带是伽
语音端点检测是语音识别系统的前端,其是指在噪声环境下准确检测出有效语音信号的起始点和终止点,为后续处理提高精度和节约时间。虽然在安静的实验室环境中,语音信号的端点
单粒子效应是引发航天器异常的主要原因。在数字电路中单粒子效应主要包括单粒子翻转(SEU)和单粒子瞬态(SET),前者发生在时序元件中,表现为逻辑状态的翻转;后者发生在组合逻辑
学位
图像分割技术是图像分析乃至高层图像理解的重要基础,广泛应用于工业、医学、地理学、交通等领域,越来越受到学者们的关注。理论的创新促使基于特殊理论的图像分割算法层出不
本实验的目的是选择适合修饰人红细胞Rh血型的甲氧基聚乙二醇衍生物,将RhD(+)血型改造为RhD(-)血型,为解决临床上RhD(-)血源严重缺乏打下基础。 实验比较了四种不同端基的甲
在植物基因工程研究中,质体是继核转化之后又一新的遗传转化和表达受体.质体转化体系具有可同时进行多基因转化;细菌的基因和很有应用价值的人类的cDNAs可以不经过密码子的修