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背景： AMA1和EAB-175是恶性疟原虫入侵红细胞的两个关键蛋白，同时也是当前研制疟疾疫苗的主要靶点。由于两个抗原均具有高度的多态性，研究非洲不同地区恶性疟原虫（Pf）的裂殖子顶端膜抗原1（apical membrane antigen-1, AMA-1）Ⅰ区基因序列特征，初步探讨其多态性形成的原因和机制，为进一步了解Pf AMA1基因多态性的分布情况并为疟疾疫苗的研制提供了一定的分子基础。了解该地区恶性疟原虫红细胞结合抗原175（erythrocyte binding antigen-175）Ⅲ区中F片段和C片段出现的频率（在单个疟原虫中有且仅有一个F片段或C片段会出现），以探讨不同虫株感染与宿主体内虫密度之间的关联性。 方法： 使用免疫胶体金法试剂盒和显微镜镜检(WHO规定确诊疟原虫的标准方法)及荧光定量PCR进行了虫种鉴定，筛选确诊为恶性疟原虫感染的病例。征得患者同意后，收集患者手指末梢血2-3滴，滴于滤纸上，待滤纸干燥后，编码并记载各个病人病案记录后收入塑料密封袋中制备干血片，室温下干燥后置于-80℃冰箱冻存。采用Chelex-100提取滤纸血样中的DNA，制备实验样本。巢式PCR扩增Pf AMA1Ⅰ区(498bp)和恶性疟原虫EBA175Ⅲ区（F片段和C片段，长度分别为795bp和714bp）。凝胶电泳鉴定扩增产物，将扩增产物纯化并测序。使用 DnaSP5.10、MEGA5.0等在线生物软件将测序结果进行分析并讨论。 结果： Bioko岛51例恶性疟原虫样本中有41种AMA1单倍型(H=41)，其中有24种单倍型在基因库中无100％吻合序列，多态位点（S）为45个，核苷酸多样度（π）为0.028±0.001；在41例非洲大陆国家样本中有31种AMA1单倍型(H=31)，其中有9种单倍型在基因库中无100%吻合序列，多态位点（s）为40个，核苷酸多样度（π）为0.027±0.001。两组样本中性检验结果中除了MK检验有统计学意义，其他均无统计学意义；两组样本连锁不平衡指数R2随着核苷酸遗传距离增加出现下降趋势。 对Bioko岛样本的EBA-175Ⅲ区F/C片段进行测序，测序成功的样本为134个。将样本数按F片段感染、C片段感染以及F/C混合感染分为3组，分别为110例（82.1%），15例（11.2%）和9例（6.7%）。使用单因素方差分析检验3组样本的疟原虫密度是否有差异，结果显示混合感染组虫密度分别与另外两组虫密度之间差异具有统计学意义，而F片段感染与C片段感染病例之间的虫密度差异无统计学意义。使用秩和检验对不同年龄段患者虫密度进行统计分析，发现不同年龄段患者之间虫密度无统计学差异。 结论： 恶性疟原虫样本顶端膜抗原1（AMA-1）Ⅰ区具有较高的核苷酸多态性和单倍型多态性，可作为恶性疟原虫研究的靶向分子，对了解恶性疟原虫的遗传特征有一定的参考意义。Pf AMA-1Ⅰ区基因多态性的产生可能是自然选择和基因内重组共同作用的结果。研究结果为进一步了解疟疾流行特征及疟疾疫苗的研制提供了分子基础。EBA-175Ⅲ区F/C片段混合感染的患者体内虫密度高于两者单独感染的患者，这为制定疟疾的临床治疗方案提供了分子基础，可在一定程度上，避免因过度治疗或治疗力度不够而形成疟疾耐药。