陕西省木蓝属根瘤菌遗传多样性研究

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本论文综述了根瘤菌多样性、分类和多相分类技术的研究进展;采用遗传型分析(16S rDNA PCR-RFLP,nodA PCR-RFLP,nifH PCR-RFLP,recA基因全序列分析)等多相分类技术,对20株分离自陕西省的木蓝属根瘤菌,首次系统地进行了遗传多样性及系统发育研究。结果表明,陕西省木蓝属根瘤菌具有丰富的遗传多样性。在16S rDNA PCR-RFLP分析结果的基础上选取有代表性的菌株进行16S rDNA全序列系统发育地位分析,揭示代表菌株的系统发育地位。结果表明,这些菌株分布在根瘤菌属(Rhizobium)、中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)以及根瘤菌属(Rhizobium)和土壤杆菌属(Agrobacterium)的交叉分支上。对各个群的代表菌株的recA基因进行全序列测定,其分析结果进一步验证了这20株菌的16S rDNA全序列系统发育地位。利用PCR-RFLP技术对20株木蓝属根瘤菌的nodA和nifH基因片段进行研究,发现来自根瘤菌属、中华根瘤菌属、中慢生根瘤菌属系统发育分支上的菌株都得到了nodA和nifH PCR扩增产物,同时来自根瘤菌属和土壤杆菌属交叉分支上的7株供试菌株也都得到nodA和nifH PCR扩增产物。以供试菌株的nodA和nifH基因全序列构建系统发育树,结果表明,木蓝属根瘤菌具有很大的结瘤基因(nodA)和固氮基因(nifH)遗传多样性,具有5种16S rDNA PCR-RFLP遗传图谱类型的20株木蓝属根瘤菌具有4种nodA PCR-RFLP遗传图谱类型和5种不同的nifH PCR-RFLP遗传图谱类型。来自根瘤菌属与土壤杆菌属交叉分支上的(Rhizobium / Agrobacterium)7株菌具有2种nodA PCR-RFLP遗传图谱类型和2种nifH PCR-RFLP遗传图谱类型;而来自R. indigoferae的5株菌有3种不同的nodA PCR-RFLP遗传图谱类型和3种nifH PCR-RFLP遗传图谱类型;来自S. fredii的2株菌和来自M. amorpha的2株菌以及来自S. meliloti的3株菌,每个群都只有1种nodA PCR-RFLP遗传图谱类型和1种nifH PCR-RFLP遗传图谱类型。这三个群的菌株表现出共生基因与16S rDNA在系统发育上的一致性。此外,来自不同种的具有不同16S rDNA PCR-RFLP遗传图谱类型的菌株却具有相同的nodA和nifH PCR-RFLP遗传图谱类型,这说明nodA基因和nifH基因可能在根瘤菌的不同种间发生了水平转移。通过回接实验对位于Rhizobium / Agrobacterium交叉分支上的7株菌进行结瘤的验证。我们选择的4种寄主植物分别为:多花木兰(Indigofera amblyantha)、红三叶(Trifolium pratense)、紫花苜蓿(Medicago sativa L.)和大豆(Glycine max(L.) Mer)。实验结果表明,菌株CCNWSX0505能使红三叶根部结瘤,而且结瘤数目较多。选择其中2个根瘤进行透射电镜实验,我们可以从电镜图片上看到明显的根瘤菌类菌体。然后我们又对这些根瘤里的根瘤菌进行重新分离纯化然后测序,结果表明,其16S rDNA序列与原菌株的16S rDNA的序列的相似性为100%。从这些实验结果我们可以得出,位于Rhizobium / Agrobacterium交叉分支上的7株菌可能构成了Rhizobium / Agrobacterium交叉分支上的一个新的种群。
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