科技资金是国家通过财政预算和科技税收优惠等方式直接和间接用于科学技术活动的经费,主要用于支持市场机制不能有效配置资源的基础研究、前沿技术研究、社会公益研究等公共科技活动。在当今世界,科技水平已经成为衡量一个国家综合国力和发展潜力的重要指标,许多发达国家都在科技发展上投入巨资以维持本国在这一领域的领先地位。近年来,我国中央财政用于支持科技发展的资金也快速增长,目前规模已经相当可观。但是这部分资金的投入是否能取得令人满意的回报则仍未可知。因此科技资金的绩效问题逐渐引起了人们的关注。政府绩效审计作为一种由审计机关对政府公共管理活动的经济性、效率性和效果性进行评价,并据此提出相关改进建议,促进政府改善公共管理,提高管理绩效的审计活动,已经成为各国都比较青睐的审计模式。目前我国的科技资金也已经开始进行绩效审计。但是尽管已经取得了一定的成果,对科技资金的审计仍以传统的财务收支审计为主,单独的绩效审计几乎没有；审计对象的涉及面比较有限,参与审计的主体较少,审计质量难以满足社会各界和政府的要求。科学技术在国民经济发展中的重要地位、科技资金在政府预算支出中占比的快速增长以及科技资金绩效审计的发展现状等等,这一切都对政府审计部门加强对科技资金的绩效审计监督提出了更高要求。因此审计机关必须进一步研究当前经济社会形势下财政科技资金绩效审计的运作模式,为国家制定更为科学合理的科技发展战略规划提供服务。尽管当前许多地区已经开始了科技资金绩效审计的尝试,取得了一定的成果,但是目前我国科技资金绩效审计整体的发展情况还不能让人满意。具体来说,仍存在着审计力量不足、过分关注合法性目标、审计深度不够、发展水平不均衡等缺陷,急需做出改进。因此,对当前我国科技资金绩效审计的情况进行探讨,总结其不足并提出相应对策,对于发展我国科技资金的绩效审计,推动科教兴国战略的实施有很强的现实意义。本文首先回顾了科技资金的一些特点,介绍了科技资金绩效审计在实务中审计方法、内容和绩效评价指标体系,并且比较了科技资金审计和其他审计的不同,并且回顾了我国科技资金绩效审计的发展历程,总结了我国科技资金绩效审计存在的不足,并且结合案例分析进行说明。在此基础上,本文提出了发展我国科技资金绩效审计的几点建议：一是注重对科技管理体制有效性的监管,推动科技体制改革；二是加强科技资金全过程审计,深化科技资金管理；三是深化审计内容,注重对重点项目的审计；四是审计过程要更加关注绩效,尤其是科研项目的产出问题；五是增加审计力量的投入,缩小地区差距。