近年来,我国深入实施创新驱动发展战略,加快推进以科技创新为核心的全面创新。如何促进企业创新已经成为我国经济在新时代下亟待解决的重要问题。科技型中小企业作为技术创新投入和创新成果产业化的主体,普遍具有轻资产、企业规模较小的特点,虽然成长性较高,但往往面临严峻的融资约束问题。由于股权质押融资成本低、手续简便,已成为科技型中小企业进行外部融资的常用途径。我国新三板市场定位于服务创新型、成长型的中小企业,股权质押也为新三板众多高科技、轻资产企业提供了可行便捷的融资渠道,极大地缓解了新三板科技型中小企业融资约束问题。以2015-2018年新三板高端制造业、软件和信息技术服务业、科学研究和技术服务业企业为研究样本,并以其中基础层和创新层的子样本表示不同成长阶段的企业,采用调节效应模型探究科技型中小企业股权质押、研发投入与企业价值评估之间的关系。首先探究股权质押和企业价值之间的关系,其次探究股权质押对企业研发投入的影响,最后建立股权质押、研发投入和企业价值的调节效应模型,在对全样本进行实证分析的基础上,再采纳现有新三板企业基础层和创新层的分层结果,对基础层和创新层两个子样本进行实证分析,进一步探究不同成长阶段下,科技型中小企业股权质押、研发投入和企业价值的关系。研究结果表明,股权质押在研发投入和企业价值之间发挥了调节作用,科技型中小企业股权质押会抑制企业的研发投入,不利于企业价值的提升。同时发现,相较于创新层,基础层企业的股权质押融资行为对研发投入和企业价值的调节作用更为强烈。在实证研究的基础上,选取两家基础层案例企业和两家创新层案例企业,根据模型评估新三板基础层和创新层案例企业价值,并验证评估模型的有效性。评估结果表明,企业的评估价值与实际价值之间的误差在可以接受的范围之内,并且在考虑股权质押因素下,评估偏差率明显低于不考虑股权质押的影响,这在一定程度上说明了股权质押背景下,研发投入和企业价值的模型在科技型中小企业价值评估领域的可行性和有效性。此外,对比分析创新层和基础层的评估结果,可知在基础层考虑股权质押因素对提高企业价值评估结果准确性的作用更大。这一结果对于完善不同成长阶段下科技型中小企业的融资结构、促进企业技术创新和提升企业价值具有重要现实意义,也为企业价值评估提供新的视角和方法。