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【目的】回顾总结食管胃交界癌根治术后的患者的临床资料和生存信息，探讨食管胃交界癌临床病理特征及术后治疗特点与预后的关系；研究MACC1、C-Met、CTEN在食管胃交界癌癌组织中的表达情况，探讨上述因子表达与各临床病理特征及预后的关系；寻找可能预测治疗效果、复发转移风险及死亡风险的分子标志物，从而为临床个体化治疗提供理论依据。【方法】回顾性分析2008年1月至2013年6月我院行根治术治疗及随访资料完整的食管胃交界癌病例，对其临床病理特征、术后治疗特点及生存信息进行相关分析；将上述患者的手术病理标本制成组织芯片，应用免疫组化技术检测肿瘤相关因子MACC1、C-Met、CTEN在食管胃交界癌癌组织中的表达情况，采用SPSS19.0软件包统计分析上述因子表达与各临床病理特征、治疗疗效及生存预后之间的关系。【结果】1、160例食管胃交界癌中位随访时间为64.7个月，截至随访终点112例（70.0%）患者出现复发转移，103例(64.4%)患者死亡。中位DFS为18.2个月，中位生存时间29.3个月，5年的总生存率为36.4%。2、全胃切除、癌栓，TNM分期，术后辅助化疗及周期是影响DFS的独立风险因素，而全胃切除、肿瘤大小、癌栓、TNM分期，术后辅助化疗及周期是影响OS的独立风险因素。3、术后辅助化疗较单纯手术可以改善食管胃交界癌总体预后；4-6周期术后辅助化疗较为合理；含奥沙利铂方案或含多西他赛方案辅助化疗对食管胃交界癌预后没有影响（P＞0.05）。4、MACC1、C-Met、CTEN的表达高低与癌组织的浸润深度、淋巴结转移、术后是否合并癌栓、临床TNM分期等表达具有相关性。5、 MACC1在癌组织中的高表达率为60.0%（96/160），明显高于癌旁组织中的高表达率6.29%（10/159,1例缺失）；单因素分析示：MACC1低表达的者DFS和OS较高表达组是明显延长的，差别具有统计学意义（DFS:53.2月VS12.5月,P=0.000；OS:未达VS21.7月,P=0.000）；C-MET在食管胃交界癌组织中的阳性表达率为57.5%（92/160），高于癌旁组织中的高表达率12.9%（20/155,5例缺失）；单因素分析：C-MET低表达患者的DFS和OS较高表达组是明显延长的，差别具有统计学意义（DFS:56.0月VS12.9月, P=0.000; OS:未达VS27.8月,P=0.000）；CTEN在癌组织中高表达率为46.8%(75/160),明显高于癌旁组织中的高表达率为27.8%（44/158，2例缺失），单因素分析：CTEN低表达患者的DFS和OS较高表达组相对延长，差别具有统计学意义（DFS:43.1月VS12.8月, P=0.000；OS:未达VS19.4月,P=0.001）。6、MACC1、C-Met、CTEN三个因子的表达之间具有相关性（P＜0.05）。7、MACC1、C-Met、CTEN三者共同高表达时，与单项或双项高表达，三项共低表达相比，DFS和OS相对缩短，差异具有统计学意义(DFS:P=0.002, OS:P=0.000)。【结论】全胃切除、癌栓，TNM分期，术后辅助化疗及周期是影响食管胃交界癌DFS的危险因素；而全胃切除、肿瘤大小、癌栓、TNM分期，术后辅助化疗及周期是影响OS的危险因素。MACC1、C-Met、CTEN高表达时，患者的预后生存较差，且MACC1的高表达是影响食管胃交界癌复发转移、死亡的独立危险因素。MACC1、C-Met、CTEN三个共高表达的患者，与未共高表达相比，预后较差,提示三者共高表达可能是胃食管交界癌的不良预后因素。