税收是国家运行的支柱,在国家治理体系中起着基础性、保障性的作用。2018年,随着税收征管体制的改革,国税、地税合并,原国税、地税下属的稽查局也被撤销,同时成立了跨区域稽查局。跨区域稽查局成立的重要意义在于一定程度上堵塞了国税、地税分别稽查造成的查处漏洞,减轻了企业负担,简化了稽查执法流程,是优化政府职能,促进营商环境和谐发展的重要环节。不同于先前的稽查执法存在诸多漏洞,如区分税种多头稽查、重复检查等,跨区域稽查局整合了稽查人力、业务,突破了地域限制,同时也带来了新的问题,如稽查干部业务素质参差不齐,稽查案件增多但人力资源不足,稽查时限要求严格但查办难度过大等。纳税人的经济活动具有流动性,涉及到的行业、部门、地区很多,税收违法行为具有隐蔽性,呈现“高智商”违法犯罪的特点。在这样的稽查执法背景下,单靠跨区域稽查局难以完成稽查任务,提高稽查效率,维护稽查执法的公正和权威性,也难以震慑税收违法行为,保障国家税收收入,因此,需要与各部门进行协作,整合各部门资源,合力打击税收违法行为。本文结合案例分析和理论分析的方法,以曲靖市跨区域稽查局为例,介绍了曲靖市跨区域稽查局的组织架构、部门职能分工,以及稽查执法的四环节,即选案、检查、审理、执行环节所涉及到的部门协作的内容,并将部门协作对象分为“税务系统内部协作”、“税警协作”、“司法协作”、“金融部门协作”、“异地稽查局协作”来总结和分析部门协作的现状,提炼出目前曲靖市跨区域稽查局在部门协作中主要存在的问题是缺乏协作法律指导、信息共享渠道不畅、稽查案件移送困难等,运用协作治理理论分析问题的成因,主要是协作法律机制不完善、协作文化不健全、缺乏协作监督、协作配套资源缺乏导致的,在此基础上,结合整体政府理论提出的合作跨界,注重顶层设计,加强各部门沟通与协调等观点,提出优化曲靖市跨区域稽查局部门协作的对策,包括完善协作法律、健全协作机制及监督机制、建立协作文化和优化协作资源配置。