ASH2L在MLL基因重排急性白血病对HOXC8基因的组蛋白修饰调控机制研究

来源 :南京医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:Bai_cat
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分HOXC8基因在MLL重排急性白血病中的表达研究目的:伴有混合系白血病-1(mixed lineage leukemia-1,MLL1)基因重排的急性白血病大多伴有HOXC8基因调控异常。为了探讨MLL基因重排急性白血病中Ash2蛋白对靶基因HOXC8的组蛋白甲基化调控作用,我们检测了两种MLL基因重排急性白血病细胞系(RS4:11和THP-1细胞)中同源盒基因(homeobox gene,HOX)—HOXC8的表达情况。方法:采用实时定量逆转录PCR技术、SYBR Green荧光染料法检测RS4:11和THP-1细胞中HOXC8的mRNA表达水平,运用循环阈值(cycle threshold,Ct)比较法进行相对定量分析,上述基因的相对表达量以公式2(-△Ct)表示。结果:HOXC8基因较高水平表达在两种MLL重排细胞系中,HOXC8在RS4:11细胞中表达更稳定。结论:HOXC8属于MLL调控的靶基因,本研究中HOXC8高表达的实验数据为我们后续的组蛋白甲基化研究奠定了基础,HOXC8在MLL重排急性白血病中潜在的调控机制在第二和第三部分有待验证。第二部分MLL重排急性白血病中siRNA干扰ASH2L基因后HOXC8基因启动子区H3K4三甲基化修饰目的:在MLL重排急性白血病中,单独MLL1融合蛋白只有极低的酪氨酸甲基转移酶活性催化组蛋白H3的第4赖氨酸(H3K4)三甲基化。为探讨含SET1功能域的蛋白复合物(complex proteins associated withSetl,COMPASS)中的另一成员-ASH2L是否对HOXC8基因启动子区有直接或间接的甲基化修饰作用,我们通过敲除ASH2L后分析HOXC8启动子区的组蛋白H3的第4赖氨酸(H3K4)三甲基化。方法:采用siRNA干扰MLL重排急性白血病细胞(RS4:11和THP-1细胞系)ASH2L基因后,染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,CHIP)联合实时定量PCR技术(real-time PCR,RT-PCR)分析HOXC8启动子特异性位点以及RBBP5、WDR5、MLL基因和核小体重塑因子最大的亚单位植物同源结构域(plant homeodomain,PHD)finger 转录因子(bromodomain and PHD finger transcription factor,BPTF)的表达。结果:ASH2L基因敲除后,HOXC8基因和蛋白水平随之下调,RS4:11细胞中HOXC8启动子区(promoter)-3K和转录起始区域的H3k4me3的修饰有明显的减少;THP-1细胞中HOXC8启动子区-3k、-2k和第一内含子1.4k区域的H3k4me3的修饰都有明显的减少(P<0.05)。SiRNA干扰ASH2L后,在RS4:11细胞中,BPTF在HOXC8的启动子区-1.4k、+2k、+3k的3个位点的结合均减弱(P<0.05);RbBP5在HOXC8的启动子区-1.4k、+2k、+3k、Ok的4个位点的结合均减弱(P<0.05);WDR5在HOXC8的-1.4k、+2k的2个位点的结合均减弱(P<0.05);MLL在HOXC8的-1.4k、+2k的2个位点的结合都有减弱(P<0.05)。在THP-1细胞中,siRNA干扰ASH2L后,BPTF在HOXC8的启动子区-1.4k和+3k的2个位点的结合均减弱(P<0.05);RBBP5在HOXC8的启动子区-1.4k和+3k的2个位点的结合减弱(P<0.05)。结论:以上实验结果显示,在MLL重排急性白血病中,ASH2L不能单独执行甲基转移酶的功能,可能需要通过COMPASS复合物中的其他成员和染色质重塑因子BPTF相互作用激活HOXC8基因。第三部分ASH2L和其他调控蛋白在MLL重排急性白血病中的相互作用机制研究目的:前两部分的研究我们证实了在MLL重排急性白血病中,ASH2L和HOXC8基因的组蛋白甲基化有相关性,我们将继续研究ASH2L和MLL甲基化酶复合物中的其他调控蛋白在MLL重排急性白血病组蛋白甲基化中的作用关系。方法:针对MLL1、WDR5、RBBP5、BPTF基因,我们筛选出最佳的MLL1-C、WDR5、RBBP5、BPTF siRNA干扰片段。针对ASH2L与这些调控蛋白的作用研究采用RT-PCR和western blot检测技术。结果:除了 ASH2L,WDR5、RBBP5、MLL1 和 BPTF 蛋白对 HOXC8 基因的表达也有影响。RS4:11细胞在沉默ASH2L后WDR5和RBBP5蛋白水平都分别出现明显下调(P<0.05),虽然MLL蛋白水平也有下调趋势,但没有统计学意义(P>0.05)。结论:由于野生型MLL1蛋白在MLL重排急性白血病中只能对靶基因发挥很弱的作用,WDR5可能代替了 MLL1执行主要的甲基转移酶修饰的功能。我们推测ASH2L可能和RBBP5形成异源二聚体的稳定结构,进而通过和WDR5的有序结合,采用协同作用的方式进一步放大组蛋白修饰作用,以调控靶标HOXC8基因H3K4的超甲基化。
其他文献
背景肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,其中约80%为非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC)。在NSCLC的治疗中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)为代表的分子靶向治疗药物日渐突出。EGFR-TKI人群选择性强,目
研究目标:观察新型AKT-S6K1双重抑制剂AT7867抗人结直肠癌细胞作用,明确其作用机制研究方法和内容:1.经不同浓度AT7876处理不同时间后,四甲基偶氮唑蓝(MTT)法、台盼蓝(Trypan blue)染色法、细胞集落试验(Clonogenicity assay)检测结直肠癌细胞存活、死亡及细胞增殖的变化。2.经不同浓度AT7876处理不同时间后,Caspase试剂盒方法、Annexin
第一部分胆管癌中microRNA差异的筛选和验证[目的]在胆管癌肿瘤组织及其癌旁胆管组织中筛选microRNAs的差异表达,为下一步的研究选择研究对象。[方法]采用高通量MicroArray表达谱芯片检测20对胆管癌及癌旁胆管组织中miRNA的表达差异;通过实时定量PCR在胆管癌组织和胆管癌细胞系中,对部分miRNA的表达差异进行验证。[结果]同癌旁胆管组织相比较,胆管癌组织中一共有10条miRN
目的:胃癌是世界第五大常见肿瘤以及第二大肿瘤致死疾病。每年有约951,000新发病例以及723,000死亡患者。超过70%的胃癌发生在发展中国家,超过半数发生在东亚地区(主要在中国)。我国胃癌的流行病学态势尤其严骏。多种因素例如基因背景、幽门螺旋杆菌感染、吸烟、饮食结构等都可以影响胃癌的发生与发展,其中基因水平的调控十分重要,但是我们对胃癌发生发展的潜在机制仍了解不足。心房钠尿肽(ANP)的功能已
目的 分析老年哮喘急性发作合并肺部感染与肺泡表面活性蛋白D(SP-D)基因多态性的相关性。方法 选取2018年10月-2020年10月商丘市第一人民医院收治的107例老年哮喘急性发作合并肺部感染患者为研究组,同期老年哮喘急性发作未合并肺部感染患者129例为对照组,收集感染患者痰液样本进行病原菌培养和药敏试验,采集两组患者外周静脉血检测SP-D基因多态性。结果 107例老年哮喘急性发作合并肺部感染患
口腔鳞状细胞癌(Oral squamous cellcarcinoma,OSCC)是口腔颌面部最常见的恶性肿瘤,侵袭转移是影响其预后的最重要生物学特征,然而有关OSCC侵袭转移的调控机制尚未完全阐明。近年来的研究表明,非编码RNA在调节肿瘤生物学行为中发挥关键性作用,但在口腔癌中的研究相对较少。同源盒基因(Homeobox gene,HOX)编码转录因子在调控不同部位癌细胞生物学行为中具有特征性的
食管癌是一种高度恶性的人类消化系统肿瘤,其发病率和死亡率均居世界肿瘤疾病前列。目前我国是世界上食管癌死亡率最高的国家之一,发病率居全国各类恶性肿瘤第5位,死亡率居第4位,均远超世界平均水平。食管癌分为鳞癌和腺癌,其中鳞癌占90%,研究发现近年食管鳞癌发病率呈下降趋势,而腺癌发病率却呈现增高趋势。近半个世纪以来,国内外关于食管癌的发病机制的研究已在DNA,RNA及蛋白领域取得了一些成果,但其确切的发
【目的】研究基质细胞蛋白SPARC对于人小梁细胞(HTMC)功能的调控机制。【方法】对于体外培养的原代人小梁细胞进行加压培养,培养压力分别为0、30、60 mm Hg,培养时间为0、24、48小时,QPCR检测富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(SPARC)、金属蛋白酶-15(MMP-15)、胞浆附着蛋白(ZO-1)的mRNA表达量变化;用FITC-Phalloidin染色观察HTMC中F-actin的分
背景:胰腺癌是人类已知恶性程度最高的癌症之一,早期诊断及早期防治是改善胰腺癌患者预后的关键,而针对癌前病变和“炎-癌”转变机制的研究被人们寄予厚望。纤维结缔组织反应作为肿瘤微环境的重要成分参与胰腺癌进展,但其在胰腺癌前病变中的发生特点及机制尚不明确。方法:通过Masson三色和α-SMA免疫组化染色,观察人胰腺上皮内瘤变病灶中的纤维结缔组织反应和胰腺星状细胞的激活;利用Image J软件对病理染色
子宫基质细胞在胚胎植入后会发生大量的增殖和分化,这一过程被称为蜕膜化。已有很多分子被报道在这一生理过程中起到重要作用,但其涉及到的表观遗传学调控机制仍不清楚。视网膜母细胞瘤结合蛋白7(Retinoblastoma binding protein 7,Rbbp7)被认为是多种组蛋白修饰复合体和染色质重塑复合体的核心组分之一。在本研究中,我们首先通过原位杂交和免疫组织化学技术揭示了Rbbp7在小鼠围植