蛋白质和核糖核酸（RNA）是生物体内非常重要的大分子。蛋白质是生命活动的载体。由DNA的一级序列如何得到能发挥各种功能的蛋白质是一个具有重要科学意义的课题。人们对蛋白质的折叠进行了深入的研究，但至今未能根本解决问题。RNA分子是遗传信息的载体。RNA分子的折叠问题相对于蛋白质起步晚，研究起来也更为复杂。人们对RNA的折叠机制还不十分清晰。利用计算机模拟的方法研究蛋白质及RNA分子的折叠问题的研究有助于我们理解蛋白质及RNA的折叠性质，并可能指导实验通过改变蛋白质及RNA序列治疗一些疾病。本文利用Gō模型对蛋白质及RNA的折叠问题进行了研究。　　本文第一部分利用改进的Gō模型对蛋白质折叠模拟进行了研究。通过改变嗜热蛋白质(Bc-Csp)关键残基上的带电量，研究了突变电荷对蛋白质折叠性质的影响。结果显示嗜热蛋白质的S48E与V62H的双突变体没有改变蛋白质的二态性，并且拥有更好的热稳定性和更快的折叠速率。同时发现突变电荷的引入使得C端稳定性增强，而对N端影响不大，折叠路径有改变的趋势。　　本文第二部分通过自主编写fortran程序，利用Gō模型对RNA分子进行了分子动力学模拟。模型选用三点简化的方式，在势能项中考虑了碱基相互作用和堆积相互作用。模拟取得了初步进展，成功完成了一个核糖开关分子和四膜虫Ⅰ型内含子结构域的折叠。并对模拟中遇到的问题进行了分析和说明。