基于代谢组学和蛋白质组学技术的阿霉素致大鼠心力衰竭机制研究

来源 :天津中医药大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:FLASH920
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
心力衰竭(Heart Failure)是病理生理原因极其复杂的疾病,诊断和治疗难度大,病死率极高。临床上治疗心力衰竭的药物有助于缓解症状但治愈率低,而且目前研究发现的许多心力衰竭的治疗靶点均具有成药性低等缺点,因此发现心力衰竭疾病新的关键靶点极其重要,这不仅有助于多靶点治疗,也有助于在心衰的治疗上有关键的突破。本研究采用阿霉素进行大鼠心力衰竭模型的建立,进行无靶向代谢组学和TMT标记定量蛋白质组学研究。首先,进行以UPLC-Q-TOF/MS技术为基础的无靶向代谢组学研究,获取阿霉素致大鼠心力衰竭的差异代谢物;其次,进行以TMT标记技术为基础的定量蛋白质组学研究,获得阿霉素致大鼠心力衰竭的差异蛋白;最后将两组学数据进行关联整合分析,寻找与心力衰竭之间起着桥梁作用的差异蛋白和小分子代谢产物,筛选出关键靶点及代谢通路,并采用Western bolt方法对相关的节点蛋白进行验证。主要研究结论如下:1.本研究以阿霉素为模型药来构建大鼠心力衰竭模型。超声指标结果显示,与空白组相比,模型组的EF、FS、LVPW,s均有明显降低(p<0.01),LVPW,d呈降低趋势(p<0.05),LVID,d、LVID,s显著性增大(p<0.01),说明阿霉素对大鼠心脏收缩功能和心脏结构均造成了严重损伤;生化结果显示,与空白组相比,模型组的LDH、CK和CK-MB三个指标均呈显著升高的趋势(p<0.01),表明大鼠心脏功能受损严重;病理组织学观察结果表明大鼠心肌组织损伤严重。综合以上结果可证实阿霉素致大鼠心力衰竭模型的成功复制。2.为了获取心力衰竭差异代谢标志物,采用UPLC-Q-TOF/MS技术对大鼠血浆样本进行无靶向代谢组学分析。经方法学验证、数据前处理等操作后,对数据进行了多元统计学分析,共筛选了色氨酸、酪氨酸、谷氨酰胺、α-酮戊二酸等21个心力衰竭潜在生物标志物。随后采用ROC曲线和聚类分析两种方式对筛选的生物标志物进行诊断分析,结果表明这21个生物标志物对诊断心力衰竭具有较好的准确性。最后基于Met PA数据库对这些标志物及其变化趋势进行分析,推测心力衰竭主要涉及能量代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢和甘油磷脂代谢,为心力衰竭的机制研究提供了可靠依据。3.基于TMT标记结合LC-MS/MS技术对心肌组织进行定量蛋白质组学分析,鉴定并定量出278个表达发生显著性变化的蛋白,其中118个蛋白发生上调,160个蛋白发生下调。聚类分析结果表明差异蛋白可有效将两个组分开,说明差异蛋白筛选的合理性。对差异蛋白进行GO功能富集分析,发现心力衰竭与代谢产物和能量的生成、ATP代谢过程、嘌呤核糖核苷酸代谢过程、呼吸电子传输链、葡糖糖分解代谢等重要生物过程密切相关。除此之外,KEGG通路富集分析,发现谷胱甘肽代谢、糖酵解、心肌收缩等信号通路在心力衰竭中发挥重要作用。通过对以上通路进行分析和讨论后,发现心力衰竭与氧化应激、能量代谢紊乱和心肌细胞Ca2+失衡等密切相关,为后续整合分析奠定了基础。4.基于代谢组学和蛋白质组学的结果,将二者数据进行交汇分析后发现Acaa2、Atp5j等25个差异蛋白与心力衰竭差异代谢物联系紧密,涉及的通路主要包括脂肪酸代谢、糖酵解、氨基酸代谢、甘油磷脂代谢、谷胱甘肽代谢以及心肌收缩。推测心力衰竭的重要机制是脂肪酸代谢和糖代谢的异常干扰了下游TCA循环使心肌供能不足,引起心脏ROS蓄积共同导致钙离子稳态影响心脏收缩功能。除此之外,这些蛋白大多数位于通路下游,因此找到上游关键靶蛋白极为重要。本实验还运用String数据库的蛋白预测功能,选取了蛋白质组学结果中发挥重要作用的蛋白和已知的阿霉素靶点蛋白来共同预测上游蛋白,最终富集出上游潜在关键靶点蛋白PTP1B,推测PTP1B可能是纠正心肌能量代谢紊乱及氧化应激的潜在关键靶标,这为心力衰竭疾病的有效治疗提供了一条新的思路。5.基于发现的潜在靶点蛋白PTP1B及其下游通路,本实验还采用Western blot技术检测下游IRS、HIF-1α、Nrf2以及HK-2的表达。结果表明与空白组相比,模型组中IRS蛋白的表达水平显著性上升,p-IRS1、HIF-1α、Nrf2以及HK-2蛋白的表达水平显著性下降,说明PTP1B在供能不足与氧化应激共同导致的心肌收缩失常从而引发心力衰竭中发挥着重要作用,可作为治疗心力衰竭的一个重要潜在靶点。这不仅为心力衰竭提供了一个新的治疗靶点,还为后续的新药研发等提供了新的策略,但本研究中仅进行了初步的验证,因此还需要进一步从细胞和动物水平对靶蛋白进行功能验证。
其他文献
伴随近些年经济社会飞快发展,人民的生活水平不断提升,生活耗能量不断增加,生活品质对环境保护也提出了更高要求。太阳能作为世界上最普遍、最清洁的可再生能源,因为能源的开发,已经广泛应用在了我们日常生活中,光伏并网发技术兼顾了经济发展与环境保护两者需求,是实现低碳经济发展的有效手段之一。随着越来越多的光伏并网发电系统接入配电网,其对配电网的影响也逐渐发展为不和忽视的一个变量,为确保配电网安全稳定运行、电
由个股暴跌转化而成的系统性股灾事件严重冲击了资本市场,让股价崩盘风险愈发受到关注。学者们基于信息不对称和委托代理理论解释了股价崩盘风险的成因,认为管理层的坏消息囤积行为使得公司股价偏离内在价值,当累积的坏消息最终被释放到市场,股价暴跌的可能性加大。独立董事声誉激励作为重要的公司内部治理机制,理论上能够对独立董事形成隐性约束,激发独立董事对管理层机会主义行为的监督职能,降低股价崩盘风险。但现实中,独
[研究目的]通过对骨质疏松症患者采用中医辨证论治,以判定其疗效、安全性及预后分析。[研究方法]本研究根据2015年12月-2016年12月昆山市第三人民医院门诊治疗的150例骨质疏
反鸟类在演化中作为今鸟类的姐妹群,曾在白垩纪繁盛一时,广泛分布于全球范围,基于丰富的化石发现,关于反鸟类的骨骼特征、羽毛特征以及其它组织特征,有了相当充分的研究,关于它的谱系发展也在不断扩大,对于反鸟类的研究,有利于揭示鸟类飞行、繁殖、生活习性等演化问题。本文对反鸟标本1611803N的研究包括对其骨骼、羽毛的形态进行描述,并分析其功能和作用,再根据前人建立的特征矩阵,利用TNT软件分析得出此反鸟
在大数据时代下,随着收集和存储数据的技术的发展,获得的数据也越来越复杂,函数型数据就是其中一类具有函数特性的复杂数据。在对函数型数据的建模分析中,我们会遇到这样的情形,一部分协变量是函数型数据,另外一些协变量是实值的。本文基于这样的混合数据,研究单指标部分函数型模型的参数估计问题。首先,利用K-L(Karhunan-Loève)展开对函数型协变量展开表示,获得协方差函数的特征值与特征函数,并结合函
由于热浸Zn-5%Al合金镀层拥有比常规热镀锌层更好的耐蚀性及可加工性能,因而具有广阔的应用前景。然而,热浸Zn-5%Al合金镀层在运输和储存时容易发生镀层腐蚀问题,需要进行钝
同大气压介质阻挡放电等离子体源相比,采用具有裸露金属电极结构的等离子体发生器产生大气压非平衡气体放电等离子体能够在较低的击穿电压下获得均匀的辉光放电,而且由于电极
会议
能引起鸡病的病原微生物很多,其中病毒是最主要的病原体。目前临床上常见的鸡病毒性疾病有禽流感、传染性喉气管炎、传染性支气管炎、鸡新城疫、鸡痘、鸡传染性法氏囊病、鸡传染性脑脊髓炎、鸡马立克病及鸡白血病等,已给养鸡业造成了巨大的损失。然而,在日常养鸡生产中,经常会出现不明原因的疾病感染,采用常规手段则难以实现快速及时地进行病原确定、疾病诊断与防治。以二代测序为基础的病毒宏基因组技术广泛应用于未知病原的检
提到中国近代化进程,自然离不开清末新政变法,由此打开了仿学国外先进法政制度、民主思想的大门。而在这一时期,新式建筑类型也被积极引入,虽然改革仅推行了短短十余年,但因其修建的议会建筑却在中国近代建筑史中占有重要的地位。奉天省咨议局成立于1909年,同年议会建筑开始筹建,不仅是晚清新政改革的“见证”,更是中西文化融合的“典范”。由于历史变迁,现仅存一座西配楼,奉天省谘议局西配楼于2014年被评为“辽宁
人民是立国之本,群众是执政之基。群众观点是马克思主义的基本观点。“我是中国人民的儿子。我深情地爱着我的祖国和人民。”这一观点是邓小平心系群众的重要体现。纵观邓小平的非凡经历和光辉一生,在推进中国革命、建设和改革的历史进程中,不断坚持、丰富、发展了马克思主义群众观,形成了具有鲜明特色的邓小平群众观。邓小平群众观是邓小平关于人民群众的基本观点和总体看法,是邓小平理论的重要组成部分。邓小平群众观的形成,