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目的:在动物养殖过程中常规性、非治疗性过度使用抗生素可促进动物相关甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的繁殖。而且MRSA作为食源性疾病的重要条件致病菌之一,能够通过食物链或与动物密切接触传播给人类,带来严重的公共卫生问题。本研究目的是检测猪鼻腔中金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)和MRSA的检出率,分析菌株的表型和分子特征,为预防控制动物相关MRSA的流行和传播提供科学依据。方法:采样现况研究设计,从9个猪场和3个屠宰场的1458头猪中收集鼻拭子标本。所有金葡菌进行抗生素敏感性试验,通过PCR试验检测耐药基因和毒素基因,并通过多位点序列(MLST)进行分子分型。采用对应分析探索菌株的分子分型与表型-基因特征之间的潜在关联。结果:1458头猪中,金葡菌的检出率为9.5%(139/1458),MRSA的检出率为3.3%(48/1458)。值得注意的是,97.1%的金葡菌为多重耐药菌株,主要的耐药模式是对克林霉素、四环素、红霉素和复方新诺明均不敏感。金葡菌和MRSA菌株主要的基因型别是CC9(ST9)。值得关注的是,所有金葡菌都不携带scn基因且对四环素耐药。金葡菌CC9和non-CC9菌株间耐药表型和分子特征比较发现:CC9和non-CC9菌株之间在耐药率(克林霉素、四环素、红霉素、复方新诺明、利福平和利奈唑胺)、耐药基因携带率(erm(C)、aacA-aphD、aadD、tet(K)和erm(A))、毒素基因携带率(seg、sem、seo、sep、ebpS和hlb)中均存在明显差异。MRSA CC9和non-CC9菌株之间在耐药基因携带率(tet(M)和tet(K))、毒素基因携带率(sem、seo、sep和spa)中均存在明显差异。对应分析显示,分子型别与抗生素耐药模式、毒素基因之间存在显著关联性。CC398与泛耐药有关联,CC9(ST9、ST2931和ST2454)与广泛耐药有关联,CC1(ST1)、CC5(ST920)、CC8、CC12、CC97与多重耐药有关联。ST2931、ST920、ST2454、ST1、ST2359、ST2269与携带seh基因有关联,ST9与携带多个肠毒素基因有关联;ST2931与携带hlb基因有关联,ST2454、ST2269与携带hla基因有关联,ST2358、ST2359与携带两个溶血素基因(hla和hlb)有关联,ST1、ST9与携带三个溶血素基因(hla、hlb和hld)有关联。结论:(1)MDRSA的比例高达97.1%,金葡菌主要的耐药模式是对克林霉素、四环素、红霉素和复方新诺明非敏感,提示今后需动态监测多重耐药菌流行水平的变化趋势及其对职业性动物接触人群的潜在威胁。(2)对应分析揭示,金葡菌的CC分型(ST分型)与表型-分子特征之间存在显著关联,为相关疫苗的研发提供了一些启示,并为监测菌株新的流行趋势提供了新的思路。(3)本研究结果表明,scn基因阴性可能是动物相关CC9菌株的特异性分子标志物,四环素耐药可能是动物CC9菌株的特异性表型标志物。