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【目的】为了从分子水平上阐明造成不同的小麦品种(系)中抗性淀粉含量差异的原因,以及为抗性淀粉标记辅助选择提供理论基础。【方法】本研究通过克隆抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)中淀粉分支酶SBEⅡa基因、SBEⅡb基因和SBEⅡa基因启动子序列。进行不同小麦品种(系)间基因序列比对和多态性分析,发掘影响小麦抗性淀粉合成的等位基因差异位点,并且基于等位基因差异位点设计特异性的AS-PCR引物。利用抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)进行了特异性引物筛选,开发抗性淀粉标记辅助选择的功能标记。【主要结果与结论】1、高、低抗性淀粉含量的小麦品种(系)SBEⅡa和SBEⅡb基因在籽粒中相对表达量显著差异。抗性淀粉含量高的SD06-5(RS=3.86%)中SBEⅡa和SBEⅡb基因的相对表达量仅是抗性淀粉含量低的M190(RS=0.60%)中基因表达量的50%。研究表明,小麦籽粒中抗性淀粉含量与SBEⅡa和SBEⅡb基因的相对表达量存在显著的负相关关系。2、利用RT-PCR技术克隆了不同小麦品种(系)SBEⅡa、SBEⅡb基因和SBEⅡa基因启动子序列。测序结果表明,SBEⅡa基因ORF全长2471bp,SBEⅡb基因ORF全长2510bp,SBEⅡa基因启动子序列长度2896bp。不同品种(系)中SBEⅡa、SBEⅡb基因及SBEⅡa基因启动子序列与Gene Bank中公布的小麦相应基因序列Blast比对结果相似性分别为98.64%、99.07%和99.92%。3、不同小麦品种(系)SBEⅡa基因ORF序列分析发现,在其α-淀粉催化酶结构域和羧基C-末端分别发现一个变异,氨基N-末端结构域前面的序列中,新春12号、M150、M190、SD06-5、安农90202和新春19号相对其它品种(系)发生了6个单核苷酸变异;比对不同小麦品种(系)SBEⅡb基因ORF序列发现,M190、阜春1号、新春12号和宁春4号这四个品种(系)相对于其它品种(系)在其氨基N-末端前面的序列中有12个单碱基变异导致相应位点上氨基酸的变异,α-淀粉催化酶结构域中有3个突变位点,羧基C-末端结构域中,M65、SD06-5、波塔姆和野猫相对于其它品种(系)有2个突变位点,M190、阜春1号和新春19号相对于其它品种(系)有一个突变位点。对供试小麦品种(系)SBEⅡa基因启动子序列分析发现,序列差异位点只发生在某一品种(系)中的单碱基突变、缺失或插入。4、SBEⅡa和SBEⅡb生物信息学分析发现,两基因均包含了氨基N-末端结构域、α-淀粉酶羧基C-末端结构域及α-淀粉催化酶结构域。初步推断,SBEⅡb基因ORF2248和2302等位位点A?G的突变为候选差异位点。5、根据候选差异变异位点设计了AS-PCR特异性引物2248A8、2248A9、2248S3和2302A8、2302 S4、2248S5。AS-PCR结果显示,4对引物的相互补充利用可以有效地用于小麦抗性淀粉含量分子标记辅助选择。本研究通过对抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)中淀粉合成关键酶SBEⅡa、SBEⅡb基因及SBEⅡa基因启动子序列比对分析发现,在SBEⅡa基因启动子序列及其ORF全长序列中未发现有效影响小麦抗性淀粉合成的等位基因差异位点;在SBEⅡb基因ORF序列中2248、2302等位位点上A?G的突变是有效影响小麦抗性淀粉合成的等位基因差异位点之一。