S-受体激酶信号传导元件THL2和MOD编码基因的克隆测序及生物信息学初探

来源 :西南农业大学 西南大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:Mr_Law
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该研究以西南农业大学繁育的高度自交不亲和的西园4号甘蓝和2001817油菜为试材,采用生物信息学的方法全面研究和探索性的分析了THL2基因和MOD基因的DNA与cDNA序列,首次从序列数据出发研究这两个编码基因的结构与遗传变异,以及在自交不亲和性信号转导中的作用机理.主要工作和结果如下:1.THL2基因的克隆与序列分析;提取甘蓝和油菜的基因组DNA和柱头总RNA,采用PCR和RT-PCR技术扩增THL2 DNA和cDNA,对目的带进行回收,克隆并测序.2.MOD基因的克隆与序列分析;以甘蓝和油菜的基因组DNA和柱头总RNA为模板,采用PCR和RT-PCR技术扩增MOD DNA和cDNA,电泳后对目的带进行回收、克隆、两端验证,测序获得其DNA和cDNA序列.3.THL2和MOD基因的表达模式分析;提取甘蓝不同组织的总RNA,进行定量RT-PCR分析,结果表明THL2基因和MOD基因在各组织中都有表达,都属于组成性表达基因.4.THL2和MOD的生物信息学特点;利用在线服务器或生物软件研究了THL2和MOD的生物信息学特点,包括同源性分析、蛋白质的进化关系、蛋白质模体分析以及预测蛋白质高级结构等.
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