水稻（Oryza sativa L.）是全世界上最重要的粮食作物之一。稻瘟病、褐飞虱是对水稻生产构成严重危害的病虫害。生产实践证明，水稻抗性品种的选育和利用是防治水稻病虫害行之有效的主要措施之一。而利用SSR标记辅助选择培育抗病虫新品种是当前最经济有效的防治这些病虫害的方法。　　 在本次试验中，我们以具有抗褐飞虱基因Bph18(t)的水稻材料C4064为抗虫供体亲本，以携带抗稻瘟病基因Pi9的抗病品系75-1-127为抗病供体亲本，以性状优良的恢复系测679为轮回亲本。采用杂交、回交、自交和田间多代选择，在分离群体中，利用与Bph18(t)紧密连锁的SSR标记KC16进行分子标记跟踪目标基因Bph18(t)，利用Pi9紧密连锁的SSR标记pB8进行分子标记跟踪目标基因Pi9,同时进行恢复力测定。主要结果如下：　　 1.通过亲本的多态性分析表明：Pi9的SSR分子标记pB8在抗感亲本间表现明显的多态性，说明可以利用这一标记在亲本组合后代进行SSR分子标记跟踪选择。　　 2.通过有性杂交、回交和田间多代选育，利用SSR标记辅助选择在BC3F1群体中获得Pi9、Bph18(t)双基因聚合个体21株。　　 3.对BC2F1群体中具有Pi9、Bph18(t)双基因聚合个体17株进行稻瘟病接种鉴定，全部表现高抗。表明双基因聚合系中的Pi9能在Bph18（t）存在的情况下正常表达抗性。　　 4.对BC2F1世代的恢复力测定，BC2F1对谷丰A具有良好的恢复力。　　 5.新开发出的KC16和KCIF/T4AR具有良好的多态性和重复性，完全可以用本研究的分子辅助选择育种。