基于转录组测序的番茄类ASR基因耐盐机制研究

来源 :天津大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mixiaoya2008
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高盐逆境严重影响植物生长,许多功能基因的表达受盐胁迫诱导或抑制,从而在植物抗逆应答中起重要调节作用。课题在研究番茄萌芽期、幼苗期耐盐生理基础上,通过转录组测序筛选耐盐目标基因。分别以盐耐受型(LA2711)与盐敏感型(ZS-5)番茄为试验材料,系统研究所选目标基因ASR2-like与ASR3-like的耐盐机制。结果如下:(1)番茄萌芽期和幼苗期各项指标与盐浓度相关性良好。发芽率、发芽指数、根长等随盐浓度增大而显著减小;抗氧化酶POD、SOD和CAT活性随盐浓度增加先升后降,随处理时间延长先增加后减小;Topsis分析显示,耐盐性最佳处理条件为盐浓度200 mM、处理时间19 d。(2)转录组测序结果表明:盐胁迫下番茄有3792个显著差异表达的基因,其中参与代谢的基因数最多,2776个。从蛋白质代谢途径的全部通路入手,筛选到7个显著富集通路、17个差异表达基因。从碳水化合物代谢途径的全部通路入手,筛选到6个显著富集通路、19个差异表达基因。从盐胁迫相关通路入手,筛选到8个富集通路、17个差异表达基因。PCR验证结果与转录组测序结果一致,证明转录组测序获得的数据可靠,筛选基因在盐胁迫下显著差异表达。(3)以ASR2-like与ASR3-like作为目标基因,分析两种不同盐反应番茄LA2711和ZS-5在四种处理、七个时间、三个部位中的6个生理指标及两个基因的表达特性,结果表明两个基因为耐盐基因,以负依赖ABA的方式起耐盐作用。综合ABA响应盐胁迫作用模式与响应过程中目标基因和ABA的关系,推测两个基因可能以负依赖ABA的方式通过提高POD/CAT/SOD活性/脯氨酸含量应答盐胁迫。
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