人类免疫缺陷病毒（Human Immunodeficiency Virus,HIV）感染会导致机体CD4+T淋巴细胞进行性减少及免疫功能减退,从而使机体容易发生各种感染。口腔念珠菌感染被认为是HIV感染者常见的初期症状之一,是口腔临床医生发现可疑感染者的临床指导依据,对HIV感染者口腔中微生物的研究有助于了解感染的发生和发展。目前,对HIV感染者口腔微生物的研究主要集中在细菌领域,虽然有很多的研究关注口腔真菌微生物,但更多的是关注口腔中可培养的真菌微生物如HIV感染对口腔念珠菌的影响,对很多不可培养的口腔真菌微生物的作用还不是很明确。目的:本研究采用第二代测序技术（Next-Generation Sequencing,NGS）比较分析HIV未感染者与HIV感染者基线时及抗病毒治疗（Antiretroviral Therapy,ART）6个月后口腔唾液真菌微生物多样性及群落结构,探讨HIV感染和ART治疗对口腔真菌微生物的影响,以期为口腔真菌微生物的研究有所指导。方法:纳入30例近一年内尚未进行抗病毒治疗的新发HIV感染者和30例HIV未感染者,要求所有研究对象无系统性疾病和口腔黏膜疾病,收样前3个月内未使用抗生素;对30例HIV感染者进行追踪随访,收集其抗病毒治疗6个月后的样本,其中失访6例,最终共84份口腔唾液样本,提取样本总DNA,采用NGS分析唾液中真菌微生物多样性及群落结构。结果:1.通过使用Illumina Mi Seq测序平台进行高通量测序共获得5,021,621条有效序列,使用usearch软件在相似性100%水平上聚类,84个样本共计得到5820个ZOTU（Zero-radius Operational Taxonomic Units）,与UNITE数据库进行比对和物种注释,共获得11个门、38个纲、86个目、179个科和306个属水平上的物种;2.Alpha多样性分析结果显示HIV感染组口腔唾液真菌微生物的丰富度和均匀度显著高于HIV未感染组和ART治疗组（p＜0.05）;3.在门水平上,担子菌门、被孢霉菌门和壶菌门的相对丰度在HIV感染组显著高于HIV未感染组和ART治疗组（p＜0.05）;4.在属水平上,念珠菌属、被孢霉属、马拉色氏属、青霉属、拟青霉属等的相对丰度在HIV感染组高于HIV未感染组和ART组;5.相关性分析发现被孢霉属、马拉色氏属、拟青霉属和毛壳属等与病毒载量（VL）呈中度正相关,Thyrostroma、Archaeorhizomyces与病毒载量呈中度负相关,而与CD4+T细胞呈中度正相关。结论:1.HIV感染组口腔唾液中真菌微生物的丰富度和均匀度高于HIV未感染组和ART治疗组,说明HIV感染和ART治疗会影响口腔真菌微生物群落组成;2.被孢霉属、马拉色氏属、青霉属、拟青霉属、毛壳属是与HIV感染显著相关的“核心”真菌微生物组;3.被孢霉属、马拉色氏属、拟青霉属和毛壳属等与病毒载量（VL）呈中度正相关,Thyrostroma、Archaeorhizomyces与病毒载量呈中度负相关,而与CD4+T细胞呈中度正相关,提示口腔真菌微生物群落结构和机体免疫状态有关。