2009年,新医改方案在万众期待下正式公布,提出了“逐步实现人人享有基本医疗卫生服务”的目标,重点突出医疗卫生的“公益性”导向。面向基层提出了改革基层医疗卫生机构补偿机制的意见,解决基层医疗机构的补偿问题。完善医疗卫生机构补偿机制,是深化医药卫生体制改革的重要内容。长期以来,基层医疗卫生机构补偿来源由三部分组成:政府补助收入、医疗服务收费和药品收入。由于补偿机制不合理,存在明显缺陷,导致医疗机构“以药养医”的逐利行为,加重群众“看病难、看病贵”问题。实施基层医疗卫生机构补偿机制改革后,基层医疗卫生机构运行成本通过政府补助收入和服务收费补偿,取消药品加成,基层医疗卫生机构将面临严峻考验。本论文从新医改的角度出发,研究基层医疗卫生机构补偿机制,丰富医疗机构补偿机制的研究体系,为本地区政府部门深化医药卫生体制改革提供参考和借鉴,有利于促进基层医疗卫生机构改变“以药养医”运行机制,有利于医疗卫生改革健康有序地进行,有利于医疗卫生事业的健康发展,促进社会的安定和谐。本文采用文献研究法、调查研究法、比较分析等研究方法,以广东省江门市蓬江区基层医疗卫生机构为例,针对乡镇卫生院、社区卫生服务机构的补偿机制现状和问题进行研究,对实施补偿机制的有关政策进行分析,探索完善相关补偿机制的应对措施,并对地方政府如何完善基层医疗卫生机构补偿机制提出以下措施:突出政府在补偿机制改革中的主导作用,建立以政府“购买服务”为主的补偿机制,健全基层医疗卫生机构运行补偿机制,强化绩效考核完善激励约束机制,推进基层医疗卫生机构补偿机制的配套制度改革。