tRNA及其来源片段在系统性红斑狼疮疾病进展中的功能研究

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目的:tRNA及其来源片段在系统性红斑狼疮的发生发展中起着重要的调控作用。我们首次选用tRNA作为研究切入点,研究tRNA表达谱、tRF/tiRNA等,寻找并验证与SLE相关的tRNA及其来源片段,为研究SLE的发病机制提供新的角度。方法:本研究通过分别收集20例确诊SLE的患者及正常对照组的外周血样本,经过提取核酸,构建RNA测序文库,经过高通量测序和生物学信息分析,建立SLE患者及与正常对照组之间的转运RNA及tRNA来源片段(small RNAs derived from transfer RNA,tsRNA)差异表达谱,在找到有统计学意义的差异性表达tRNA及tsRNA的前提下,运用tRNAscan-SE对靶基因预测。对靶基因进行基因富集(GO)与基因通路生物信号学分析(KEGG),发掘tRNA及tsRNA在SLE发病过程中起的作用,进一步阐明SLE的发病机制。结果:本研究构建了SLE相关tRNA及tsRNA测序文库,101个tRNA和355个tsRNA在正常对照组与SLE组的外周单个核细胞中的表达差异具有统计学意义,对差异表达的tRNA以及tsRNA进行GO分析及KEGG分析。富集分析结果显示差异表达tRNA及tsRNA相似,都是主要参与调节了免疫应答、免疫反应过程等。KEGG分析提示SLE中差异tRNA直接与系统性红斑狼疮相关信号通路有关,而在SLE中差异表达的tsRNA参与了T细胞受体信号通路、Th1和Th2细胞分化及原发性免疫缺陷等信号通路。结论:tRNA及其来源片段在系统性红斑狼疮与正常人的表达存在差异,差异相关基因参与系统性红斑狼疮疾病发生,调节炎症的发生。
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