NR3C2在非小细胞肺癌中的表达调控、功能及临床意义的初步研究

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yichunjekiyi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:肺癌(Lung cancer,LC)在我国乃至全球范围内,仍然是导致人类高发病率和死亡率的一种恶性肿瘤。LC主要由小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC)组成,其中NSCLC是最常见的类型,在所有肺癌中占比五分之四以上。NSCLC由肺鳞癌(LUSC)、肺腺癌(LUAD)和大细胞肺癌(LUCC)组成。NSCLC恶化程度高,诊断和治疗方法选择有限,因此筛选新的有效早期诊断生物标志物和治疗靶点,深入探索NSCLC致病分子机制具有十分重要的理论和临床应用意义。基于此,课题组前期通过组学数据筛选发现NR3C2(核受体亚家族3,组C,成员2)可能是一个潜在的重要诊断标志物和治疗靶点。通过查阅文献发现,NR3C2是一种盐皮质激素受体,编码MR蛋白,在肝癌、结肠癌、乳腺癌、胰腺癌等多种癌症类型中发挥抑癌作用。最新一项通过对NSCLC细胞进行全基因组致死性筛查的研究发现,NR3C2可能是一种潜在的肿瘤抑制因子。我们通过生物信息学(Bioinformatics)筛选证实NR3C2在NSCLC中表达显著下调。然而,NR3C2在肺癌患者中改变的临床价值、生物学功能和发挥作用的可能分子机制尚不清楚。本研究中,我们采用生物信息学和组织芯片等技术方法,通过对不同数据库中病人信息的挖掘分析,探索NR3C2在NSCLC患者中的表达及调控方式、诊断和预后意义,并初步解析了该基因的功能。目的:本研究旨在分析NR3C2在非小细胞肺癌及其亚型中的表达、临床病理特征、诊断及预后意义,揭示NR3C2在肺癌中表达变化的调控方式和可能的作用及机制,探讨其与免疫细胞及肿瘤微环境的关系,为NSCLC诊断、预防和靶向治疗提供理论依据和新思路。方法:1.通过UCSC网站下载NSCLC及其亚型LUAD和LUSC的基因表达数据、临床病理资料、拷贝数变异相关数据与甲基化数据;2.利用Graph Pad Prism软件分析NR3C2的表达在NSCLC及其亚型的癌组织与癌旁正常组织中的差异,Mann-Whitney U秩和检验及卡方检验分析NR3C2 m RNA表达水平与患者临床病理资料之间的关系;3.采用Kaplan-Meier法评价NR3C2基因表达在NSCLC、LUAD和LUSC患者中以及不同临床特征患者中的预后价值;4.通过计算受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,简称ROC曲线)下面积(AUC)评估NR3C2表达变化在NSCLC、LUAD和LUSC中的诊断价值;5.采用NR3C2抗体在含有92例肺腺癌和88例癌旁样本的组织芯片进行免疫组织化学染色和定量分析,评估NR3C2在肿瘤患者中的诊断价值,预后意义以及与患者年龄、性别、AJCC分期、淋巴结转移等临床特征的关系;6.通过相关性研究在NSCLC、LUAD和LUSC中分析NR3C2基因表达分别与其拷贝数变异之间的关系,在LUSC中分析NR3C2基因表达和DNA(启动子)甲基化之间的关系;7.通过构建差异表达细胞模型分析NR3C2在肿瘤中的主要功能,采用CCK8分析肿瘤细胞增殖情况、流式细胞仪分析肿瘤细胞周期变化、Trans well实验分析肿瘤细胞迁移和侵袭能力变化;8.使用ESTIMATE算法确定NR3C2是否与肿瘤微环境(TME)有关,通过TIMER在线数据库获得免疫细胞浸润数据,并采用Pearson相关分析进一步评估免疫浸润各成分与NR3C2表达的关系;9.通过Linked Omics门户网站中的Link Finder模块获取NR3C2在TCGA-LUSC和TCGA-LUAD中共表达基因,对其进行GO分析和KEGG分析。通过STRING在线网站构建NR3C2基因的蛋白质网络互作图并预测其功能。结果:1.NR3C2在NSCLC及其亚型LUAD和LUSC患者中均低表达(P<0.01),这种低表达与患者不同临床特征资料显著相关;2.Kaplan Meier生存曲线提示在NSCLC和LUAD中,NR3C2高表达组患者总生存率比低表达组更高(Logrank P<0.01);而且在NSCLC患者NR3C2预后价值与临床分期相关,在LUAD患者NR3C2预后价值与淋巴结转移及临床分期相关;3.ROC曲线分析显示,NR3C2表达改变在NSCLC、LUAD和LUSC患者中均具有较高的敏感性和特异性(P<0.01,AUC>80%),具有候选诊断标志物价值;4.组织芯片免疫组化定量分析结果显示,NR3C2蛋白表达与LUAD患者的性别和分期显著相关(P<0.05);LUAD患者NR3C2低表达组的生存期明显短于高表达组(Logrank P=0.0353),NR3C2表达变化对LUAD诊断具有较高的敏感性和特异性(P<0.01,AUC=84.82%),是LUAD患者潜在的重要诊断和预后评估标志物;5.在NSCLC和其亚型LUAD中,NR3C2低表达与其拷贝数缺失呈正相关(P<0.01),而且NR3C2拷贝数变异(Copy number variation)在不同性别、不同吸烟状态的患者中分布明显不同;6.在LUSC组织中,NR3C2表达与其启动子区平均甲基化水平呈负相关,这种关联与患者年龄及肿瘤大小密切相关,而且NR3C2启动子甲基化水平对LUSC诊断具有较高的敏感性和特异性;7.NR3C2基因高表达可能通过影响肿瘤细胞周期而抑制肿瘤细胞增殖,同时也可以显著抑制肿瘤细胞的转移和侵袭能力;8.在NSCLC及其亚型LUAD和LUSC患者中,NR3C2表达与肿瘤微环境的重要指标免疫评分、基质评分和肿瘤纯度密切相关;9.功能和信号通路富集分析结果显示,在LUAD中,NR3C2共表达基因主要参与姐妹染色单体凝聚、纺锤体微管、驱动蛋白复合物等生物学过程,主要富集到DNA复制、细胞周期、P53等信号通路;在LUSC中,NR3C2共表达基因主要涉及基底外侧质膜、顶端质膜、蛋白质性细胞外基质等,主要富集到蛋白消化吸收富集,肥厚型心肌病(HCM)、3K-Akt等信号通路;10.蛋白质网络互作分析表明,与NR3C2相互作用的关键蛋白质主要有NR3C1、CAPZA1和AHR等分子,这些互作分子主要参与细胞周期、凋亡等生物过程以及PI3K-Akt等肿瘤相关信号通路。结论:1.NR3C2在NSCLC及其亚型LUAD和LUSC组织中表达明显降低,该表达变化具有明显的临床病理特征;2.NR3C2表达在NSCLC及LUAD和LUSC中均具有较好诊断价值和预后评估价值,提示可能是一个重要的诊断和预后标志物;3.在NSCLC和亚型LUAD,NR3C2表达与其拷贝数变异相关,而在LUSC,NR3C2表达与其启动子DNA甲基化紧密关联;4.NR3C2能够显著抑制肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭能力。
其他文献
鸡传染性法氏囊病是由传染性法氏囊病毒引起的一种急性、接触传染性、免疫抑制性传染病,本文就一例中麻鸡传染性法氏囊病从其发病情况、临床症状、剖检症状、类症鉴别诊断、实验室诊断、防治措施、临床病理图等进行叙述,供养殖户参考。
期刊
近几年,在全球范围内患自闭症的儿童数量快速上涨,随着我国医疗水平的提高以及社会各项福利政策的完善,越来越多人关注到自闭症儿童这一群体,然而,至今都没有针对自闭症的良药,他们只能通过日复一日的康复训练来改善和缓解症状。我国对自闭症儿童的康复空间环境研究还处于起步阶段,已经建成的康复中心往往忽略了室内环境对人的生理、心理、行为起到的潜移默化的影响。家庭作为自闭症儿童日常生活的场所,其环境更是几乎不被人
学位
西古城是渤海国时期的重要城址,该城址的考古发现、学术研究、保护利用是东北亚地区国际性热点、敏感的学术问题。关于西古城的始建年代、行政建置功能,国际学术界始终未能达成共识性学术认知。这种研究状况在一定程度上制约了该城址的科学保护、合理应用。为此,通过收集考古发掘资料,重新界定了西古城的建置特点;通过梳理学术研究史,以全新的理念、全新的学术切入点解读了该城址在渤海国历史中的角色定位;通过考察西古城的环
学位
安东尼奥·洛佩斯·加西亚是二十世纪西方写实主义绘画代表画家之一,在具象绘画道路上不断地探索。在洛佩斯的艺术生涯中,无论具象表现时期、魔幻现实主义时期还是具象写实主义时期的作品,写实主义表现手法始终伴随着洛佩斯,本文着重研究魔幻现实主义时期的作品进行分析。洛佩斯在1956年至1965年对这一时期的为数不多的作品都是他全新的探索和尝试,他的作品题材多样,画风细腻,能将不同时间与空间的事物紧密结合,不仅
学位
黄连、三七为我国传统中药,前期研究发现,黄连和三七中提取的总生物碱和三七总皂苷,用于治疗糖尿病合并并发症的效果较好。其中,黄连总生物碱中小檗碱、表小檗碱、黄连碱、巴马汀为主要活性成分;三七总皂苷中三七皂苷R1、人参皂苷Rb1、人参阜苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rd为主要活性成分。为了进一步探究黄连总生物碱与三七总皂苷组合物的安全性和有效性,本论文在前期研究基础上,对黄连总生物碱与三七总皂苷组合
学位
本文以巴尔蒂斯画面结构为主线进行论述,进而思考如何在实践中扩展自己的艺术思维,并寻找适合自己的油画语言。文章分为三大章节,第一章节从巴尔蒂斯画面结构特点入手,从绘画特征与表现形式两方面分析和论述,也是画家对我创作产生影响的原因。第二章通过借鉴画家画面结构中的构成因素分析,对我创作中产生的启示与思考。第三章论述本人在创作过程中的具体实践,以及如何运用、吸收这些因素并融入到我的油画创作中去。我对巴尔蒂
学位
自2019年新冠爆发以来,人类财产安全和健康受到了巨大威胁,对人们生活及工作造成了极大影响。中国人民坚韧奉献、团结协作,共同构筑起抗“疫”的钢铁长城。在此期间,涌现出大量艺术创作。从目前所见的“抗疫”主题系列作品,不但彰显了中国人民的伟大力量和勇于奉献的精神,也讴歌了人民在灾难面前万众一心、勇往直前的精神,同时提升了艺术创作者们的社会责任感和创作认识。梳理当前所见“抗疫”主题美术作品,对当前“抗疫
学位
当我们面对多元化境遇下的中国当代绘画艺术成就的同时,不难发现的是,在油画民族化的征程中,绘画创作在表现形式和内容、创作观念、材料运用等方面都有了前所未有的发展和演变。能从众多致力于个性化意识形态和各具特色的绘画形式中独善其身且独树一帜的以传达和表现人文精神及内心情感需要的画家就应该是段正渠了。段正渠笔下的自然和人物形象是沿着自己饱有的内心情感线索而衍生、存在和发展的。在他的作品中,陕北与黄河的壮美
学位
作为一种发病率较高的精神类疾病,抑郁症严重威胁着人类的健康,有大量患者因其自杀行为而致残致死,已成为中国乃至世界的沉重负担。抑郁症的发病机制复杂,病因不明确,多种因素如心理因素、生理因素、社会因素都会引发抑郁症。目前有关抑郁症发病机制较为公认的假说包括:单胺类神经递质假说、下丘脑-垂体-肾上腺素轴亢进学说、谷氨酸及其受体假说、神经营养学说、神经可塑性假说、细胞因子假说、肠道菌群学说。临床中常用的抗
学位
21世纪是科技、经济高速发展的时代,快速、多变是这个时代的代表特征。作为世界经济体的一部分,我国也在这种时代洪流中实现着社会主义现代化建设的跨越式飞进。国家的变革和发展导致人们生产、生活节奏加快,压力不断增加,这使人们对情感慰藉的需求愈加强烈。而豢养宠物就成为许多家庭和个人缓解压力的主要选择之一,宠物犬也因此越来越多的走入不同家庭,与人类的联系日渐紧密。但是任何事物都具有两面性,有爱犬的人存在,也
学位