寡核苷酸芯片技术杂交条件优化研究

来源 :山东省医学科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:w198911154
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目的:探讨寡核苷酸芯片探针固定化的方法,研究寡核苷酸芯片的重复性与Spacer和探针长度之间的相关性,优化杂交条件.探讨由空白玻片自己处理成氨基玻片和醛基玻片的方法,以及采用PCR方法制备探针进行长片段靶序列杂交检测的方法.结论:通过优化杂交条件可以有效地提高杂交效率.选择spacer为poly(dT)15的25mer和30mer的探针可以获得较好的重复性.由空白玻片处理得到的氨基玻片和醛基玻片可以代替购买的氨基玻片用于实验,可以获得理想的检测结果,且成本低廉.对于500bp以下的较短的靶序列可以采用带有较短的spacer如poly(dT)10~15和较短的如20~25mer探针即可获得理想的杂交结果.而对于较长的如750bp左右的靶序列,spacer为poly(dT)15探针长度为25~30mer亦可获得理想的杂交结果.对于1k左右的靶序列,采用短探针难以获得理想的稳定的杂交结果,采用PCR方法制备的长探针可以获得较好的杂交结果.
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