在我国建设创新型国家的大环境下,创新已经成为区域经济发展的原动力和衡量一个区域竞争力的关键因素,某一地区良好的创新绩效不仅来自于区域内各个创新主体内部活跃的创新能力,更来自于良好的区域合作,因此区域创新能力的提高和区域合作的具体内容密切相关。随着知识经济的发展和全球化程度的日益加深,世界经济发展呈现出区域化的特征,区域间的联系更加紧密,区域间的合作也变的越来越多。如何通过有效的合作内容提升区域创新能力成为我们所面临的重要问题。本文在区域合作和区域创新能力的现有研究基础上从以下三个方面展开研究：首先,分析了我国东西部区域合作的主体,区域合作的效果以及区域创新能力的现状和地区差异性。从现有的东西部区域合作内容出发通过文献计量方法总结得出,东西部研发合作、东西部技术转移是东西部合作中影响区域创新能力的主要合作内容。其次,分析了东西部研发合作和技术转移对区域创新能力的具体影响过程,建立了评价东西部研发合作和技术转移效果的评价指标体系,并对我国东西部省市的区域研发合作和技术转移进行了评价。评价发现我国东西部的研发合作和技术转移效果因地域差异也相差较大。为了进一步寻找出研发合作和技术转移对区域创新能力影响的大小,文章以东西部22省市的研发合作、技术转移的评价数据为基础,建立回归模型估计东西部研发合作和技术转移对区域创新能力的影响系数。分析结果表明,技术转移对区域创新能力的影响作用较研发合作的作用大,且研发合作和技术转移对区域创新能力五个构成因素的影响也不尽相同。最后,本文在上述研究分析的基础上提出了未来通过加强东西部区域合作提升区域创新能力的政策建议,并指出了本文的研究不足以及未来的研究方向。