中国汉族人群DNA双链断裂修复基因多态与脑胶质瘤遗传易感性关联研究

来源 :复旦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lijb2009
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背景和目的:胶质瘤是最常见的一类原发性脑肿瘤。尽管胶质瘤的病因目前还不十分明确,但流行病学资料显示电离辐射是被确认的危险因素之一。电离辐射可以造成包括DNA单、双链断裂(DSBs)在内的各种形式的DNA损伤。而DNA损伤(尤其是DSB)遗留不修复,有可能导致染色体畸变,进而引发疾病或癌症。然而,受到电离辐射暴露的个体中仅一小部分发生胶质瘤,提示胶质瘤的发生可能与个体的遗传易感性也有关。越来越多的流行病学证据显示DNA修复基因多态是导致个体间DNA修复能力和癌症发生风险差异的主要原因。近来,有报道称胶质瘤患者对γ射线诱导的染色体断裂易感,而这种易感性可能受到DSB基因的遗传变异的影响。因此,DNA双链损伤修复基因遗传多态有可能与胶质瘤遗传易感性相关。DNA双链断裂损伤修复有两种主要方式:同源重组(HR)和非同源末端连接(NHEJ)。这两种DSB修复途径既独立,功能上又互补。DNA DSB修复涉及许多基因参与,而每个基因在其中都扮演着独特的角色。XRCC3基因编码蛋白参与DNA双链断裂/重组修复,并且作为Rad-51相关蛋白家族的成员参与DNA损伤同源重组修复,以维持染色体稳定性。在NHEJ修复过程中,首先DNA依赖蛋白激酶复合体识别DSB,并且随后将LIG4/XRCC4复合体招募到DNA末端,并使末断发生连接反应。DNA-PK由Ku蛋白异二聚体(即Ku70/Ku80,分别由XRCC6/XRCC5基因编码)调节亚基和DNA-PKcs催化亚基组成。DNA-PK不仅参与IR诱导的DNA损伤修复过程,而且在B细胞和T细胞的分化过程中参与V(D)J重组。DNA-PK缺陷小鼠对IR高度敏感,而且表现出严重的联合免疫缺陷。有研究显示,DSB修复基因多态参与组成个体的肿瘤遗传易感性,与多种肿瘤的发生相关。然而,还很少有关于DSB修复基因多态和脑胶质瘤发生风险的报道。因此,本研究旨在探讨中国汉族人群中XRCC3,XRCC5,XRCC6和XRCC7基因多态与脑胶质瘤的发生风险是否存在相关。此外,涉及蛋白间相互作用的DNA-PK异源三聚体,有可能对胶质瘤的发病产生协同作用。因此,本研究就XRCC5、XRCC6和XRCC7基因间的交互作用在胶质瘤发病中的潜在作用作一探讨。材料和方法:本研究采用医院为基础的病例-对照研究设计。简言之,随机入选2004.10-2006.5期间华山医院收治的经组织病理确诊的771例胶质瘤患者。752例非癌症对照为性别、年龄、居住地区(城市或乡村)与病例相匹配、年龄差别不超过5岁的同期华山医院急救中心非癌症外伤患者(20%)和门诊健康体检者(80%)。对每一位受试者进行面对面的问卷调查,问卷内容包括受试者的人口统计学信息、职业电离辐射暴露史、癌症家族史和健康指标。使用盐酸胍DNA抽提法提取所有外周血样本的基因组DNA。首先,根据国际人类基因组单体型图计划(http://www.Hapmap.org)提供的基因型数据,应用Haploview软件选取标签SNPs。然后在所有771例胶质瘤患者和752例对照中应用荧光5’核酸酶TaqMan分析技术对所选标签SNPs进行基因型鉴定。应用最大拟然算法(Arlequin 2.000软件)计算对照组人群中标签SNPs两两间连锁不平衡统计值D’和r~2。应用非条件Logistic回归模型评估单位点或多位点基因型与胶质瘤发生风险的相关程度,并计算比数比(ORs)及95%可信区间(CIs)。采用最大期望值算法(Haplo.em程序)估计单体型频率,而病例组和对照组间单体型分布差异采用比分检验统计(Haplo.score程序)进行评估。此外,使用Phase 2.0软件进行双单体型推断,而基因-基因间交互作用则应用多因子降维法(MDR)进行评估。结果:第一部分:XRCC3基因四个常见SNPs被选为标签SNPs。各多态位点在对照和病例中的分布都符合Hardy-Weinberg平衡。病例/对照组中各位点少见等位基因分布频率分别为:SNP rs861530G=0.468/0.424,rs861531T=0.071/0.069,rs3212092T=0.049/0.032,rs861539T=0.057/0.059。单位点分析显示SNP rs861530基因型在对照和病例组中的分布频率统计学上存在显著差异(P=0.006)。在非条件Logistic回归分析中,经年龄和性别校正后,SNP rs861530G等位基因(GG+GA与AA相比:OR=1.437:95%CI=1.15-1.795)和rs3212092T等位基因(TT+TC与CC相比:OR=1.656;95%CI:1.115-2.462)与脑胶质瘤的发生风险显著相关。总体比分检验显示病例和对照组中XRCC3基因单体型的构成存在统计学差异(global stat=20.82:P<0.000)。与常见单体型“AGCC”相比,单体型“GGCC”和“AGTC”与脑胶质瘤的发生风险显著相关,OR值分别为1.35(95%CI=1.14-1.58)和1.67(95%CI=1.11-2.52)。进一步行双单体型分析,结果提示携带‘AGCC/GGCC”,“GGCC/GGCC”,或“GGCC/AGTC”双单体型的个体发生脑胶质瘤的风险分别是“AGCC”单体型纯合子携带者的1.50倍(95%CI=1.15-1.96)、1.75倍(95%CI=1.24-2.46),或5.18倍(95%CI=2.31-11.64)。第二部分:单位点分析显示XRCC5基因标签SNPs(SNP1 rs828704 A/C,SNP6rs3770502 G/A和SNP7 rs9288516 T/A)各基因型在病例组和对照组中的分布统计学上存在显著差异,P值分别为0.005,0.042和0.003,经Bonferroni多重校正后,SNP1rs828704 A/C和SNP7 rs9288516 T/A位点仍有意义。尽管XRCC6基因标签SNP4rs6519265 A/G基因型在病例组和对照组间存在统计学上的差异(P=0.044),但经Bonferroni多重校正后统计学上无差异,而XRCC7基因标签SNPs各基因型在两组间分布无差异。进一步行非条件Logistic回归分析显示,在共显性遗传模型下,XRCC5基因SNP1 rs828704 A/C变异基因型AC与基因型AA相比显著降低胶质瘤的发生风险,其校正OR直为0.78(95%CI=0.54-0.92)。而XRCC5 SNP6 rs3770502 G/A变异基因型GA和SNP7 rs9288516 T/A变异基因型TA分别与GG和TT基因型相比,显著增加胶质瘤发生风险,校正OR值分别为1.29(95%CI=1.02-1.65)和1.52(95%CI=1.19-1.93)。此外,与GG基因型相比,XRCC6基因SNP4 rs6519265 G/A位点基因型GA也显著增加胶质瘤的发生风险(校正OR=1.51;95%CI=1.11-1.95)。单体型关联分析提示XRCC5基因单体型“CAGTT”对胶质瘤的发生具有保护作用,与单体型“CGGAT”相比胶质瘤发生风险大约降低40%。此外,本研究发现XRCC5,XRCC6和XRCC7基因(形成DNA-PK三聚复合体)的五个SNPs(即XRCC5 rs668844和rs207916,XRCC6 rs132770和rs132779以及XRCC7 rs7830743)间存在交互作用,构成预测胶质瘤发生的最优模型。结论:本研究结果提示在中国汉族人群中DSB修复基因遗传变异与脑胶质瘤发生相关,有可能是决定胶质瘤个体遗传易感性的重要因素。
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