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[目的]分析粤西地区汉族人群Omi/Htra2基因启动子-958C/G、内含子5-59A/G、编码区1195G/A单核苷酸多态性(SNPs)频率分布特点,并探讨其与帕金森病(PD)发病的关系。
[方法]采用病例-对照研究,选择粤西地区汉族人群中56例PD病人(病例组)和109例健康体检者(对照组)为对象,应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测Omi/Htra2基因SNP-958C/G、5-59A/G和1195G/A,并分析其基因型及等位基因频率在正常人群及PD患者中的分布特点。
[结果]
1.Omi/Htra2基因SNP-958C/G在病例组中G等位基因频率为25.0%,对照组为15.6%,差异有显著性意义(P=0.038);病例组CC基因型为53.6%,对照组为69.7%,差异亦有显著性意义(P=0.040)。
2.Omi/Htra2基因SNP5-59A/G在病例组中A等位基因频率(46.4%)高于对照组(36.7%),差异显示有相关倾向(P=0.073);AA基因型频率21.4%亦高于对照组的11.0%,差异显示亦有相关倾向(P=0.072)。经性别分层分析发现,仅在男性中有显著性差异,病例组A等位基因频率为48.6%,对照组为34.6%,其差异有相关倾向(P=0.051);AA基因型频率(25.7%)高于对照组(10.3%),差异有显著性意义(P=0.041)。
3.在病例组中发现有1个Omi/Htra2基因1195G/A杂合子,而在对照组中没有发现。
4.经Logistic回归分析后,Omi/Htra2-958C/G多态性的CC基因型与PD的发病呈独立相关性(P=0.031);5-59A/G多态性的从基因型与PD的发病呈独立相关趋势(P=0.053);在男性中,0mi/Htra25-59A/G多态性的从基因型亦与PD的发病呈独立相关性(P=0.046)。
5.对Omi/Htra2-958C/G和5-59A/G位点进行连锁不平衡性(linkage disequilibrium,LD)和单倍体型分析,D=0.066,r2=0.001。单倍体型GA在病例组中的频率明显高于对照组,差异有显著性意义(P=8.60e-005)。
[结论]
1.Omi/Htra2基因启动子SNP-958C/G的G等位基因是PD的危险因素;CC基因型对PD有保护作用。
2.Omi/Htra2基因内含子SNP5-59A/G位点等位基因A和AA基因型均与PD有相关倾向,即可能增加PD的发病风险;5-59A/G位点AA基因型亦与PD的发病呈独立相关趋势,而且经x2检验,用性别作分层分析后,发现其相关性仅限于男性。
3.粤西地区汉族人群PD患者中发现Omi/Htra2基因编码区1195G/A杂合子一例。
4.Omi/Htra2-958C/G和5-59A/G位点组合的单倍体型中,GA单倍体型可能是PD发病的危险因素。