论文部分内容阅读
[目的]分析粤西地区汉族人群Omi/Htra2基因启动子-958C/G、内含子5-59A/G、编码区1195G/A单核苷酸多态性(SNPs)频率分布特点，并探讨其与帕金森病(PD)发病的关系。
[方法]采用病例-对照研究，选择粤西地区汉族人群中56例PD病人(病例组)和109例健康体检者(对照组)为对象，应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测Omi/Htra2基因SNP-958C/G、5-59A/G和1195G/A，并分析其基因型及等位基因频率在正常人群及PD患者中的分布特点。
[结果]
1.Omi/Htra2基因SNP-958C/G在病例组中G等位基因频率为25.0％，对照组为15.6％，差异有显著性意义(P=0.038)；病例组CC基因型为53.6％，对照组为69.7％，差异亦有显著性意义(P=0.040)。
2.Omi/Htra2基因SNP5-59A/G在病例组中A等位基因频率(46.4％)高于对照组(36.7％)，差异显示有相关倾向(P=0.073)；AA基因型频率21.4％亦高于对照组的11.0％，差异显示亦有相关倾向(P=0.072)。经性别分层分析发现，仅在男性中有显著性差异，病例组A等位基因频率为48.6％，对照组为34.6％，其差异有相关倾向(P=0.051)；AA基因型频率(25.7％)高于对照组(10.3％)，差异有显著性意义(P=0.041)。
3.在病例组中发现有1个Omi/Htra2基因1195G/A杂合子，而在对照组中没有发现。
4.经Logistic回归分析后，Omi/Htra2-958C/G多态性的CC基因型与PD的发病呈独立相关性(P=0.031)；5-59A/G多态性的从基因型与PD的发病呈独立相关趋势(P=0.053)；在男性中，0mi/Htra25-59A/G多态性的从基因型亦与PD的发病呈独立相关性(P=0.046)。
5.对Omi/Htra2-958C/G和5-59A/G位点进行连锁不平衡性(linkage disequilibrium，LD)和单倍体型分析，D=0.066，r2=0.001。单倍体型GA在病例组中的频率明显高于对照组，差异有显著性意义(P=8.60e-005)。
[结论]
1.Omi/Htra2基因启动子SNP-958C/G的G等位基因是PD的危险因素；CC基因型对PD有保护作用。
2.Omi/Htra2基因内含子SNP5-59A/G位点等位基因A和AA基因型均与PD有相关倾向，即可能增加PD的发病风险；5-59A/G位点AA基因型亦与PD的发病呈独立相关趋势，而且经x2检验，用性别作分层分析后，发现其相关性仅限于男性。
3.粤西地区汉族人群PD患者中发现Omi/Htra2基因编码区1195G/A杂合子一例。
4.Omi/Htra2-958C/G和5-59A/G位点组合的单倍体型中，GA单倍体型可能是PD发病的危险因素。