北京地区耳聋残疾人群大前庭水管相关SLC26A4基因热点突变分子流行病学调查

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耳聋严重影响人类认知和交流,给患者的生活和学习带来了极大的不便。在生活质量日益提高的今天,耳聋受到越来越多的重视。在我国,根据第二次全国残疾人抽样调查结果推算,截至2006年4月1日,听力残疾(含多重残疾)人共2780万,其中单纯听力残疾人2004万,占总残疾人口的24.16%。与此同时耳聋患者的数量也在不断增长,我国每年新增听力及语言障碍者近8万人,每年新增聋儿近3万人,其中至少一半的聋儿是由于遗传缺陷引起的,它可以由单一基因突变或不同基因的复合突变引起,也可由环境因素,或基因与环境两者共同作用而致。国内外大量研究表明,常见的遗传性耳聋由为数不多的几个热点基因突变引起,如GJB2、SLC26A4、mtDNA12S rRNA等,这也为我们开展大规模耳聋基因筛查及诊断提供了理论依据。大前庭水管是最常见的内耳畸形,其发病与SLC26A4基因密切相关,是一种常染色体隐性遗传疾病。SLC26A4基因具有广泛的遗传异质性,目前报道了近200种突变,在中国耳聋人群中IVS7-2A>G和2168A>G是热点突变,44.11%和11.60%的大前庭水管患者携带IVS7-2A>G和2168A>G这两种突变。掌握耳聋残疾人群中SLC26A4基因热点突变的分布特点,对科学指导遗传性耳聋人群的婚配具有重要的意义。目的:初步探讨SLC26A4基因热点突变在北京地区耳聋残疾人群中的分子诊断意义。通过对北京市残联组织提供的北京6247名具有耳聋残疾证耳聋残疾患者的基因检测,分析北京耳聋残疾人群中SLC26A4基因热点突变IVS7-2A>G和2168A>G发生频率,以达到初步了解北京地区耳聋残疾人聋残疾人群大前庭水管相关SLC26A4基因热点突变分子流行病学特点,以达到服务和指导临床的目的,并对此群体的婚配及优生提供科学的帮助。方法:检测原理:为以受检者DNA为模板,应用基因芯片进行9个最常见的热点基因突变位点,芯片位点包括:GJB235delG、GJB2235delC、GJB2176del16、GJB2299delAT、GJB3538C>T、SLC26A42168A>G、SLC26A4IVS7-2A>G、线粒体12SrRNA1555A>G和1494C>T。抽查北京地区持耳聋残疾证患者6247例,包括延庆地区1261例、怀柔地区1731例、门头沟地区1542例、海淀地区635例、房山地区554例、密云地区524例,其中男3398人,女2849人。提取受检者外周静脉血的DNA,进行目的PCR片段扩增,及杂交,洗片,最后利用“遗传性耳聋基因芯片检测系统”检测目的基因和位点突变情况。根据检测系统生产的数据,对本次受检的6247名受检持证耳聋人的结果进行分析,SLC26A4基因的热点突变IVS7-2A>G和2168A>G进行检测,并对其发生频率进行分析。结果:通过本次研究发现在本次受检的6247名北京地区耳聋残疾人群中,携带SLC26A4基因IVS7-2A>G和2168A>G突变的例数共计177例,总阳性检出率为2.83%(177/6247),总确诊率0.46%(41/6247)。即携带SLC26A4单等位基因突变的患者占2.83%(177/6247),携带双等位基因突变的患者占0.46%(41/6247)。共检测到突变的SLC26A4等位基因218个,突变等位基因频率(突变等位基因数/等位基因总数)为1.74%(218/12494)。有97.17%(6070/6247)耳聋残疾人未检测到SLC26A4基因的热点突变。本研究还发现同时携带SLC26A4和芯片中其它基因热点基因突变的耳聋残疾人4例,同时携带GJB3538C>T杂合突变和SLC26A4IVS7-2A>G杂合突变1例,来自怀柔区;同时携带GJB2299delAT杂合突变和SLC26A4IVS7-2A>G杂合突变1例,来自海淀区;同时携带GJB2235delC杂合突变和SLC26A42168A>G杂合突变1例,来自延庆区;同时携带GJB2235delC纯合突变和SLC26A42168A>G杂合突变1例,来自延庆区。结论:1、在6247例耳聋残疾人中,通过SLC26A4基因热点突变IVS7-2A>G和2168A>G检测,能够明确分子学诊断的占总体的0.46%(41/6247);2、在北京地区持证聋人群体中,SLC26A4基因热点突变检出率较解放军总医院门诊就诊的耳聋患者低,可能与以下因素有关:本研究仅针对SLC26A4基因热点突变进行检测而未进行全序列分析;部分持证耳聋残疾人不是先天性耳聋,如老年性耳聋、职业噪声性耳聋、爆震性耳聋其发病与SLC26A4基因热点突变关联性差;3、此项课题的开展,有助于了解北京地区残疾人群中与大前庭水管综合征密切相关的SLC26A4基因热点突变分布情况,在分子水平上为耳聋残疾人群明确诊断或指导进一步诊断,并对IVS7-2A>G和2168A>G突变检测阳性患者的婚配、生育具有一定的指导意义。
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