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本研究将DNA分子标记RAPD、ISSR、AFLP和SRAP用于莲的遗传学研究,优化了有关的反应条件,完善了适用于莲遗传学研究的DNA分子标记技术,建立了莲DNA分子标记技术体系。其中ISSR、AFLP和SRAP标记是首次在莲研究中应用。所用的材料分为两部分,12份莲材料和38份莲材料。 研究中所用的12个品种包括亚洲莲和美洲莲及它们的杂交后代,其中亚洲莲包括中国莲和日本莲,中国莲主要是大面积种植的藕莲品种。12个RAPD引物共产生128条带,平均每个引物10.67条,其中多态性条带106条(82.81%):7个ISSR引物共产生91条带,平均每个引物13条,其中多态性条带75条(82.41%);2对AFLP引物共产生72条带,平均每对引物产生36条,其中多态性条带64条(88.89%);3对SRAP引物共产生67条带,平均每对引物产生22.3条,其中多态性条带60条(89.55%)。利用非加权配对算术平均法(UPGMA)构建的进化树,从四种聚类结果中可以看出,在ISSR和AFLP的结果中这12个品种分为三大类即美洲莲、美洲莲与亚洲莲的杂交后代和亚洲莲,在亚洲莲中,ISSR的聚类结果与AFLP和SRAP的聚类结果不一样,在ISSR的聚类结果中,日本莲—大贺莲与中国莲聚在一起,没有明显的界限;在AFLP和SRAP的聚类结果中,日本莲—大贺莲与中国莲有明显的界限;在SRAP聚类结果中,有几个品种没有完全区分开。但RAPD的结果显示美洲莲与亚洲莲的杂交后代和亚洲莲聚为一类,美洲莲独为另一类。比较RAPD、ISSR、AFLP和SRAP这四种分子标记的聚类结果与它们的系谱,AFLP的结果与它们的系谱最吻合。 研究中所用的38份材料,它们包括亚洲莲和美洲莲。用RAPD和ISSR来研究它们的遗传关系。19个RAPD引物共产生212条条带,13个ISSR引物产生164条带。各个品种间的差异可以被检测出来。依据Jaccard系数建立的聚类树显示了莲的遗传关系。无论是RAPD还是ISSR,在亚洲莲和美洲莲间总有一个高的Jaccard系数,分别为0.656和0.785,表明它们之间的差异不明显。因此,我们的结果表明美洲莲作为亚洲莲的一个亚种是比较合适的。我们结果也表明日本莲应起源于中国莲。