油菜荚果转录组测序分析及油分相关候选基因的鉴别

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甘蓝型油菜(Brassica napus)由白菜(B. rapa)与甘蓝(B. oleracea)在约7500年前杂交形成,经过染色体加倍,形成了异源多倍体。在中国乃至世界,油菜是第二大油料作物,中国人的营养供给中占据着很重要的地位。随着测序技术的发展,转录组测序已广泛应用于生命科学的各研究领域。目前油菜全基因组序列已经发表,为转录组水平研究油分含量的遗传发育机制奠定了良好基础。本研究在开花后的三个不同时期,利用二代测序平台Illumina Hiseq2000对中国品种高油和德国品种Sollux的荚果进行转录组测序,分析基因差异表达,并对表达基因进行基因本体和通路分析。随后与拟南芥脂质代谢数据库中的相关基因、油菜油分含量相关QTL等信息等进行整合分析,挖掘和分析候选功能基因。主要结果如下:1、相同时期品种间和相同品种不同时期间分别检测到465和2114个显著差异表达基因;2、鉴别出八个品种间差异表达基因与拟南芥脂质代谢通路相关基因同源。分析了品种内不同发育时期脂质通路同源基因的上下调情况,结果表明大部分都随发育时期上调;3、在QTL区域鉴别出33个存在品种间差异表达的基因,其中一个与拟南芥脂质通路基因同源,是具有育种应用前景和价值的候选基因;
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