根腐病是黄瓜设施生产中的一种重要病害,多种病原均可导致根腐病的发生,且单一的连作模式会增加土壤中病原数量、加重病害的发生,造成了严重的经济损失。许多研究均报道木霉（Trichoderma spp.）在生产实践中对黄瓜根腐病良好具有较好的防治效果。为了明确黄瓜根腐病病原,筛选出高效的生防木霉菌株,探究木霉对病害防治机制,本研究对引起黄瓜根腐病的病原进行了分离、纯化与鉴定,分析了病原菌的生物学特性;筛选了拮抗木霉菌株,评价了其防病促生效果;采用扩增子技术研究了木霉对土壤微生物群落的影响。具体研究结果如下:1.采用组织分离法分离获得的菌株SCCFo1,经致病性检测,该菌株引起黄瓜种子和根茎部腐烂,最终导致植株枯死,完成科赫氏法则;经形态学和分子生物学鉴定为尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）。通过对该菌株生物学特性研究,发现SCCFo1最适生长培养基为PSA;最适生长和萌发温度分别为25℃和30℃;最适生长p H为6～7,最适萌发p H为8;明暗交替有利于孢子萌发。2.通过对峙培养发现38株木霉对尖孢镰刀菌SCCFo1均有一定抑制作用,其中7株木霉对尖孢镰刀菌的拮抗系数为Ⅰ级,且抑菌率均超过75%;通过挥发性和非挥发性物质抑菌测定发现,棘孢木霉（Trichoderma asperellum）FJ035抑菌率最高,分别为59.67%和28.28%;通过盆栽试验,显示该菌株对黄瓜幼苗根腐病的相对防效为78.88%。3.通过木霉在连作条件下对黄瓜根腐病防效测定,发现棘孢木霉FJ035处理后,可显著降低连作土壤（连作8茬,第2茬施入尖孢镰刀菌）黄瓜根腐病的发生,其发病率和病情指数分别为1.67%和1.67,相对防效达到88.57%。然而未经木霉处理的连作土壤其病害的发病率分别为35.00%,病情指数为14.58。这结果表明木霉可以有效防治连作条件的黄瓜根腐病。4.为了深入分析在连作条件下,木霉防治黄瓜根腐病对微生物群落的影响,采用扩增子测序技术分析,发现黄瓜连作增加了细菌和真菌α多样性。在连作7茬后,发现土壤区系中的细菌和真菌α多样性基本保持稳定。5.当连作土壤施入尖孢镰刀菌（在第2茬施入）会影响土壤微生物群落的组成,与连作土壤（未施入尖孢镰刀菌）对照相比,接种尖孢镰刀菌未显著影响土壤中细菌和真菌群落的多样性,其上调了Armatimonadetes和Sphingomonas、担子菌门（Basidiomycota）、青霉属（Penicillium）、Fusarium和Mortierella属相对丰度;下调了芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、Chloroflexi、Planctomycetes、Rokubacteria和Coniosporium的相对丰度。6.当棘孢木霉FJ035（第7茬施入）施入连作土壤时,与黄瓜连作（未施尖孢镰刀菌和木霉）比较,发现可以改变微生物组成,但未改变微生物群落的多样性;进一步对微生物群落组成进行分析,发现棘孢木霉FJ035处理后下调了Planctomycetes、Arthrocladium、Coniosporium和Scolecobasidium的相对丰度。当与施入尖孢镰刀菌SCCFo1（第2茬）连作土壤比较时,棘孢木霉FJ035处理也不影响微生物群落的多样性,但是上调了Rokubacteria和下调了Arthrocladium、Coniosporium、Fusarium、Penicillium、Scolecobasidium的相对丰度。通过比较分析,发现棘孢木霉FJ035上调了12个细菌OTU和5个真菌OTU,其中包括粒状胞菌属（Granulicella）、Phenylobacterium、链霉菌属（Streptomyces）、SWB02、Fusarium、Basidiomycota、Aspergillus、Coniosporium、链格孢属（Alternaria）9个属;通过属水平的分析,发现Actinoallomurus、Chthonomonas、Limnobacter、苯基杆菌属（Phenylobacterium）、短梗霉属（Aureobasidium）、近明球囊霉属（Claroideoglomus）5个属的相对丰度受木霉菌上调。然而,这些微生物的相对丰度却受尖孢镰刀菌显著下调。上述结果表明,在连作条件下棘孢木霉FJ035对黄瓜根腐病具有良好的防治效果,并且对土壤微生物的相对丰度具有调控作用,为揭示木霉防治黄瓜根腐病的机制奠定基础。