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miRNA(micro-RNA)是真核生物内源性的短链非编码RNA,在细胞生命活动中起到重要的调控作用。miRNA与siRNA(small interference RNA)组成基因沉默复合物RISC(RNA Induced Silence Compenents),通过剪切或者翻译抑制存储在P小体(Processing bodies)转录后mRNA等方式,调控其靶基因的表达水平。利用miRNA这一功能进行基因治疗逐渐引起关注。目前,关于RISC的形成过程及其与靶基因作用机制还存在很多疑问。此外,对于这些过程中miRNA与P小体的相互作用也缺乏实时直观的证据。
在本文中,我们建立高分辨成像平台,转染外源荧光标记miRNA进入细胞体内,进行实时动态观察和长时间追踪,再利用相关的图像处理软件结合编程算法对所得结果进行处理。同时,辅助采用荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction),免疫荧光染色等实验方法对相关miRNA在不同细胞系内的功能进行研究和比较。所得结果如下:
(1)采用免疫荧光染色方法,标记P小体、溶酶体等细胞内关键结构,分析miR-21在转染进入细胞之后与其相互作用,并进行定量分析。miR-21经转染后,在细胞内至少途经溶酶体、细胞质和P小体等结构,直至发挥相应的基因调控功能并最终被降解或排出细胞外。同时,miR-21能够引起细胞内P小体的聚集。
(2)利用高分辨活细胞实时成像系统,对转染的外源miR-21进行实时观察。同时,采用单分子追踪SPT(single particle tracking)对miR-21进行轨迹追踪,然后采用均方位移MSD(mean square distribution)分析这些粒子的运动状态。结果表明,外源miR-21在进入细胞之后,运动状态随其所处位置变化。整体呈受限运动,在突破溶酶体进入细胞之后呈一定的定向运动。
(3)在宫颈癌Hela和大鼠骨髓间充质干细胞BMSC两种细胞系中,分别转染miR-21,利用荧光定量PCR检测其靶基因mRNA变化,免疫荧光染色检测靶基因蛋白变化,同时检测细胞活力的变化。结果表明,miR-21在不同细胞系内发挥不同基因调控功能。
(4)在已有的实验基础上,借鉴PALM(photoactivated localization microscopy)成像方法的原理,构建超分辨成像系统。对所得图像序列进行单分子定位和后期的处理,可以得到纳米级别的分辨率,实现单分子的定位。