冠状病毒是自然界中广泛存在的一类正链 RNA病毒。冠状病毒主要感染脊椎动物，引发呼吸道、胃肠道及神经系统等相关疾病。冠状病毒亚科约含有30种冠状病毒，猫传染性腹膜炎病毒(feline infectious peritonitis virus, FIPV）是冠状病毒亚科大家族中的一员，主要在猫科动物间传播，可以起猫传染性腹膜炎（feline infectious peritonitis，FIP），致死率极高。冠状病毒基因组编码复制酶多聚蛋白pp1a与pp1ab，Pp1a和pp1ab在由病毒编码的蛋白酶切割形成亚基后进而组装形成复合物发挥其转录、复制的功能。参与切割的蛋白水解酶主要为主蛋白酶（main proteases）。主蛋白酶的切割位点十分保守，在病毒转录、复制过程中发挥关键调控作用，且与其他蛋白的同源性小，因此冠状病毒的主蛋白酶常常作为设计抗病毒药物的理想靶点。　　本论文中以冠状病毒 FIPV非结构蛋白 nsp5为研究对象，首先构建主蛋白酶的重组质粒，利用原核表达系统表达纯化FIPV主蛋白酶，获得纯度高于95％以上的目的蛋白，并将目的蛋白与N3抑制剂在合适温度与合适的浓度比例下孵育，获得二者复合物，经过一系列晶体筛选工作，我们获得了复合物的晶体，并在2.5埃的分辨率下完成数据收集工作，结构解析正在进行中。该项研究为开发克制猫传染性腹膜炎的药物提供基础。