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本研究以海生大型红藻异管藻(Heterosiphonia japonica)和多管藻(Polysiphonia urceolata)为材料，用50mmol/L磷酸缓冲液浸泡两种藻，经过超滤后用Sephadex G-200或Sephadex G-150凝胶过滤分离R-藻红蛋白并用DEAE-Sepharose FF离子交换层析进行纯化、制备R-藻红蛋白。纯化异管藻R-藻红蛋白(HR-PE)的pI为4.6，多管藻R-藻红蛋白(PR-PE)的pI为4.5。SDS-PAGE和变性等电聚焦(denaturing isoelectric focusing, denaturing-IEF)分析结果表明，HR-PE和PR-PE在SDS-PAGE中的亚基带少于其在denaturing-IEF中的有色亚基带。二维电泳中的结果证明：在SDS-PAGE中分子质量相同的亚基，在denaturing-IEF中表现出不同pI；而denaturing-IEF中的单一条带在第二维SDS-PAGE中则被分离出多于一种不同分子质量的亚基带。这表明在组成HR-PE和PR-PE亚基中，分子质量相同的同类亚基可能具有不同的pI，而在denaturing-IEF中具有相同pI的亚基可能在SDS-PAGE中表现不同的分子质量。用甲醛和EDC(1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基-碳二亚胺盐酸盐)进行的HR-PE和PR-PE化学稳定化实验结果表明：1)适合的甲醛与HR-PE反应比例为212.31.0，其适合反应浓度为0.5310mg/ml；PR-PE的适合浓度为1.11mg/ml，甲醛与PR-PE的反应比例为54.71.0；2) HR-PE与EDC的适合反应浓度分别为3.0mg/ml和3.0mmol/L，而PR-PE与EDC的适合反应浓度为3.0mg/ml和5.0mmol/L。与天然R-藻红蛋白相比，甲醛和EDC稳定化的HR-PE和PR-PE对温度、8mol/L尿素、4%SDS及8%SDS的耐受程度都有显著提高，而且甲醛稳定化产物比EDC稳定化产物有更好的稳定性。利用双功能交联剂可将HR-PE、PR-PE化学稳定化产物与免疫球蛋白共价交联。