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为培育综合农艺性状优良且氢氰酸含量极低的高丹草新品种,我们将散穗高粱与黑壳、白壳、棕壳、红壳4种苏丹草相组配进行人工授粉杂交,获得了杂种F1代。从F2代分离群体中选出超低氢氰酸含量和高氢氰酸含量的植株建立基因池,筛选出与低氢氰酸含量相关的ISSR特征片段并对部分特征片段进行了克隆与序列分析,用于对F2～F5代目标性状优良株系的辅助选择,并对F5代苗期进行超低氢氰酸ISSR特征片段进行验证,选育高丹草新品系。主要结果如下:1.散穗高粱与4种苏丹草杂种F1代的生长速度均明显超过其双亲,平均株高365～395cm,生育期131～138d,比其父本苏丹草长9～12d,较其母本散穗高粱长16～23d,均为中晚熟类型;F1代PMCMⅠ染色体配对行为规则,平均构型为2n=2x=20（10Ⅱ）,母本散穗高粱与4种父本苏丹草染色体虽有较高的同源性,但亲本间的遗传组成仍存在一定差异。2. 4个杂交组合F1代穗型均呈双亲中间型,穗子较大,每穗小穗数及其密度均超过其父本苏丹草;其单株平均分蘖数6.27～6.50个,呈偏父本遗传;而其开花期主茎的糖锤度值均较高（6.26%～6.53%）,呈偏母本遗传。F1代花粉可育率均在98%以上,自然结实率为73.66%～75.89%,均不存在育性问题。各杂交组合F1抽穗期幼穗的POD酶谱表型差异明显,可作为亲本及杂种在蛋白质水平识别的生化标记。3. 4个杂交组合F2代群体性状出现分离,但生长势良好,其平均株高为409～442cm,明显超过其双亲;其生育期为137～147d,均为晚熟类型;花粉可育率和结实率分别为94%和72%以上,也不存在育性问题;其PMCMⅠ染色体也均能正常配对,F2分离穗型幼穗的POD酶谱表型差异可为其后代优良株系选择提供依据。4.用14个ISSR适宜引物对4个杂交组合F1及其亲本基因组DNA扩增得到451个ISSR条带,多态性条带百分率高达92.2%,ISSR指纹图谱可作为亲本及杂种F1鉴定的分子依据。聚类分析将9个供试材料分为3类:第一类为散穗高粱、棕壳苏丹草、黑壳苏丹草、白壳苏丹草,第二类为散穗高粱×黑壳苏丹草F1、散穗高粱×白壳苏丹草F1、散穗高粱×红壳苏丹草F1、散穗高粱×棕壳苏丹草F1,红壳苏丹草单独为一类;散穗高粱与红壳苏丹草的亲缘关系较远,而与白壳苏丹草亲缘关系较近。5.筛选出与超低氢氰酸含量相关的ISSR特征片段11个,其中散穗高粱×黑壳苏丹草组合3个（900bp、1400bp、1600bp）,散穗高粱×白壳苏丹草组合3个（400bp、750bp、1600bp）,散穗高粱×棕壳苏丹草组合2个（750bp、1500bp）,散穗高粱×红壳苏丹草组合3个（200bp、1400bp、1600bp）。6.散穂高粱×黑壳苏丹草、散穂高粱×白壳苏丹草2个杂交组合的6个与超低氢氰酸含量有关的ISSR克隆片段—H-1、H-2、H-3和B-1、B-2、B-3的序列全长分别为:1377bp、2268bp、2614bp、1432bp、1363bp和2751bp,读码框分别为357bp、279bp、339bp、300bp、228bp、186bp。其中片段H-1与小麦亚种的同源性为60%;片段H-2与高粱假设蛋白SORBIDRAFT05g027190同源性为63.9%,与水稻粳稻组假设蛋白OsJ07776同源性为62%;片段H-3、B-1、B-2、B-3与现有已知的植物碱基序列和氨基酸序列没有同源性,推测它们是与高丹草超低氢氰酸含量关系更为密切的新的DNA序列。7. 4个杂交组合F3、F4中选株系的氢氰酸含量很低（2.58～4.77 mg/kg）、植株高大（377～405cm）、分蘖性强（单株分蘖数6.21～6.38个）、生育期较长（132～141d）,且2个世代间性状稳定。8.采用ISSR分子标记辅助选择技术,选育出散穗高粱—黑壳苏丹草、散穗高粱—白壳苏丹草、散穗高粱—棕壳苏丹草、散穗高粱—红壳苏丹草4个超低氢氰酸高丹草新品系（F5）。