干旱是影响玉米生产的主要限制因素,玉米干旱胁迫基因应答分子机制是玉米分子育种的核心理论之一。植物转录因子能够与基因启动子区域的顺式作用元件结合,抑制或激活转录,从而响应植物对干旱、高盐、低温、激素等一系列环境胁迫因子的应答反应。目前对干旱胁迫下的玉米转录因子的应答缺乏系统性分析,因此本文利用生物信息学方法和基于转录组的高通量数据比较,研究玉米转录因子的表达特性,为玉米抗旱育种提供理论依据和基因材料。以对干旱敏感程度不同的两种玉米旱21和掖478为材料,在苗期进行适度干旱胁迫,整株混合取样提取总RNA并进行转录组测序,获取数字化基因表达谱,并依此及ProFITS网站的玉米转录因子数据库为基础,对转录因子家族显著表达的基因进行统计分析。结果表明：旱21中,有166个转录因子基因显著上调表达,186个转录因子基因显著下调表达；掖478中有315个转录因子基因显著上调表达,有155个转录因子基因显著下调表达；有40个转录因子共同显著上调表达,有26个转录因子共同显著下调表达。在对这些转录因子的数字基因表达谱进行分析的基础上,利用基因本体论分析工具对涉及的代谢调控网络进行了分析,发现这些基因参与了氮代谢、大分子物质代谢、RNA代谢、信号传导细胞器合成及非生物胁迫等各个生物学途径。以玉米旱21和掖478及它们的杂交种F1为材料,采用荧光实时定量PCR方法对不同程度的干旱胁迫下转录因子家族中的ARF、AP2-EREBP及SBP家族的部分成员的进行组织表达特异性分析。研究表明：在中度干旱胁迫下,ARF、ERF及SBP基因在叶中均上调表达,在根中以下调表达为主；在重度干旱胁迫下,ARF、ERF及SBP基因在根中均表现出下调表达的趋势,在叶中旱21表现为上调,掖478及F1表现为下调。另外,ARF3和ARF5具有一种剂量效应。