目前,·我国已进入改革发展的关键时期,党的十八大明确提出要实施创新驱动发展战略,并且更加注重协同创新。随着科学技术革命在世界范围内突飞猛进,产品和技术生命周期大大缩短,国内外市场的竞争变得愈加激烈,企业将面临更加复杂更加残酷的经济环境。所以,企业在进行创新的过程中,开始不仅仅只注重单一要素的创新,而是更加注重技术、市场、制度、战略等多要素的协同创新,协同创新正逐渐成为企业提高自身竞争力的新引擎。企业协同创新的重要性已经获得了普遍的社会认知,但是由于企业协同创新的不确定性、复杂性和动态性,决定了企业的协同创新活动具有高风险特征,所以,不少企业由于过于害怕承担风险从而放弃展开协同创新活动,从而错过了发展的良机。然而协同创新过程中高风险的存在并不意味着协同创新结果的失败命运,如果能对影响企业协同创新风险的各因素进行调查与分析,并对这些风险因素采取针对分性的风险控制措施,就能将创新风险最小化,推动企业协同创新活动的良性、有序、协调发展。本文通过对企业协同创新系统管理熵理论的适用性分析和作用机理分析,将管理熵理论探索性地运用到企业协同创新系统的风险评价中,从而构建了基于管理熵的企业协同创新风险评价模型,然后在总结企业协同创新风险因素相关研究的基础上,分析了影响企业协同创新风险的十大类因素及其52个子因素,从而建立起企业协同创新风险评价指标体系,最后选取一家企业进行分析应用,即通过调查问卷法、专家咨询和专家打分法以及层次分析法进行数据的收集整理,然后运用模型计算出各项指标因素的子熵值和总熵值,并以熵值作为依据对该企业协同创新风险进行评价,总结出该企业在协同创新过程中的风险情况,并提出相应的风险控制对策建议,以供企业做适当的参考。