水稻(Orvza sativa L)精细胞RSSG8基因启动子研究

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该实验室苟小平等(2001)使用染色体步移(Genome walking)法,从籼稻Oryza sativa(indica culticar-group)桂朝2号基因组中克隆到长度为532bp的RSSG8基因启动子片段R8PN,并进行了全序列测定.利用NCBI的GenBank nr数据库对R8PN序列和RSSG8基因序列作Blastn分析,结果显示,在水稻Oryza sativa(japonica culticar-group)基因组第12染色体的AL772420.6序列和AL772425.7序列中,R8PN均与RSSG8序列呈紧密的上下游关系.利用SCBI(四川大学生物信息中心)网络数据库,将R8PN序列和RSSG8序列与籼稻Oryza sativa(indica culticar-group)基因组序列作Blastn比较,结果显示,在籼稻Oryza sativa(indica culticar-group)基因组序列Scaffold21 53序列中,R8PN和RSSG8呈紧密的上下游关系.利用PLACE网络服务器(网址http://www.dna.affrc.gojp/htdocs/PLACE)及PLANT CARE网络服务器(网址:http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/)进行启动子元件分析.结果显示,R8PN中没有典型结构的TATA-box,推测其-33~-46 AT富含区可能为特殊的RNA转录酶结合区.R8PN中多次出现CAAT-box,推测其对RSSG8基因的优势表达起着非常重要的作用.此外,G-box、GT1-motif、GATA-box、CG-motif、GAG-motif、LAMP-element等大量光反应元件也都出现在R8PN中.其中,G-box出现了6次,GATA-box、GAG-motif各出现了两次.说明RSSG8基因的表达调控很可能受光的影响.
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