结核分枝杆菌注射类二线药耐药突变检测及分枝杆菌菌种分型检测用参考品的制备

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gfjgds
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本论文主要包含两部分内容,第一部分建立了一种利用实时PCR结合探针熔解分析技术对结核分枝杆菌常用注射类二线抗结核药(卡那霉素、阿米卡星和卷曲霉素)耐药突变进行快速检测的方法。第二部分首次建立了分枝杆菌菌种分型检测用参考品,主要包括分枝杆菌培养基法和生化法菌种鉴定用的参照菌株,临床和环境常见分枝杆菌对照菌株参考品。  第一部分:由于结核分杆菌生长速度的限制,目前临床上用于检测结核分枝杆菌药物敏感性的方法一般需要数周的时间,不利于临床的诊断和治疗。因此,临床上迫切需要一种能够快速准确地检测结核分枝杆菌耐药性的方法。临床上二线药的使用越来越普遍,耐药现象越来越多,本论文建立了一种利用探针熔解分析技术对常用注射类二线抗结核药的耐药突变进行快速检测的方法。导致结核分枝杆菌对卡那霉素、阿米卡星和卷曲霉素耐药的基因存在交叉现象,主要是由rrs基因的3’末端的点突变导致的。研究表明,rrs基因的3’末端的点突变是导致注射类抗结核药耐药的主要原因,rrs1401A>G、rrs1402C>T以及rrs1484G>T等位点突变都可以导致卡那霉素、阿米卡星和卷曲霉素耐药。rrs1473G>A或G>T的突变只导致大环多肽类(卷曲霉素和紫霉素)的耐药。另外,eis启动子突变-10区和-35区的突变可以引起卡那霉素低水平耐药。通过筛选特异性好,扩增效率高的引物并结合不对称PCR技术达到扩增大量单链的目的;同时筛选可覆盖所有主要突变位点,且分型效果好的探针,通过熔解曲线过程中探针与扩增产物杂交后熔点的不同以区分野生型与突变型。首先通过人工合成靶序列初步考察探针区分野生型与突变型的能力,后经实际样本检测考察体系的分型能力,从而建立起一个快速、准确、经济的结核分枝杆菌常用注射类二线抗结核药(卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素)耐药检测体系。  第二部分:近年来,分枝杆菌病的感染率和发病率呈逐渐上升趋势,分枝杆菌菌种分型显得尤为重要。本论文建立了分枝杆菌菌种分型检测用参考品,主要包括分枝杆菌培养基法和生化法菌种鉴定用的参照菌株,临床和环境常见分枝杆菌对照菌株参考品。收集了中国食品药品检定研究院保藏的49种分枝杆菌,分别采用传统的分枝杆菌菌种鉴定方法、16S rRNA序列分析法和16S~23S rRNA转录间隔区(ITS)序列分析法等确认菌株的正确性。在此基础上,分别选择15种和23种分枝杆菌制作分枝杆菌培养基法和生化法菌种鉴定用的参照菌株、临床和环境常见分枝杆菌对照菌株参考品。将选出的15种分枝杆菌进行扩大培养,然后进行研磨、比浊、稀释、分装、保藏和污染验证等步骤,制备了分枝杆菌培养基法和生化法菌种鉴定用的参照菌株。将选出的23种分枝杆菌进行扩大培养,然后进行研磨、比浊、稀释、灭活、验证、分装等步骤,制备了临床和环境常见分枝杆菌对照菌株参考品。
其他文献
丙烯高温氯化法是国内外应用广泛的环氧氯丙烷(Epichlorohydrin,ECH)生产工艺,工艺过程主要包括氯丙烯、氯醇化和环氧三部分。该方法生产过程灵活、工艺成熟、操作稳定,但不可避免地存在能耗大的问题。采取有效的节能措施,实现装置的节能增效是十分必要的。本文建立了丙烯高温氯化法制取环氧氯丙烷装置的数学模型,并以此为基础运用夹点技术对装置的换热网络进行了分析优化。本文利用Aspen Plus对
目的:利用si RNA干扰技术干扰胱硫醚β-合成酶(cystathionineβ-synthase,CBS)基因并构建细胞氧糖剥夺再灌注(Oxygen-glucose deprivation/reperfusion,OGD/R)模型,探讨OGD/R
亚硝酸根是广泛存在于环境中的一种有害物质,尤其作为肉类食品加工中的防腐剂和发色剂应用广泛,迫切需要建立快速、灵敏、高效的痕量亚硝酸根的分析测试方法。本文应用电化学分
本文对池核沸腾时的传热及加热面上CaCO3垢的生成等复杂过程进行了实验研究与理论分析。主要工作如下: 采用极限扩散电流技术(LDCT)与直接传热测定同时进行的方法研究池核沸
  The extraction of the heavy metals from mines includes several procedures,which forms waste-waters and solid wastes.These wastes contain high content of oth
会议
本论文通过对铜湿法冶金的研究,实现了硫化铜精矿的硫酸铁电化浸出工艺,浓料液中用Lix984-煤油作萃取剂对铜的萃取分离工艺,以及浸出渣中单质硫的回收工艺。硫化铜精矿的硫酸铁电化浸出工艺中,主要考察了浸取剂浓度、浸出温度、浸出时间、液固比、氯化物的加入量以及表面活性剂浓度对浸出率的影响、得出硫酸铁电化浸出铜精矿韵最佳工艺条件:Fe~(3+)浓度1mol/L,硫酸浓度4.0mol/L,温度368K,浸
2010年底,新中国证券市场度过了20岁生日。20年来,以沪深股市为代表的中国证券市场迅速发展,许多相关行业也应运而生,伴随发展。经济证券广播20年来在为证券市场发展提供多方
  Enrichment of Mn and As in the surface of sediment caused by diagenetic process has been reported from various lakes in the world.Lake Biwa is a typical exa
会议
一氧化碳的优先氧化(CO PROX)是消除富氢气氛中微量CO的有效方法。本文采用一步共沉淀法制备了一系列不同Mn/Ce+Mn比例的CuMnCeO催化剂(CuO含量为10 wt.%),考察了其在富氢气氛下对CO PROX反应的活性。运用BET,XRD,UV-Raman,ICP-AES,TEM/HRTEM,H_2-TPR,XPS,Cu的K边XAFS(包括EXAFS和XANES)等技术对催化剂进行了详细
藏药翁布(Myricaria germanica auct.non Linn.Desv)为柽柳科(Tamaricaceae)水柏枝属(Myricaria)植物,分布于青藏高原,嫩枝叶入药,民间常用于治疗风湿痹痛。现代药理实验研究表明,藏药翁布具有治疗大鼠佐剂性关节炎[1]、抑菌、抗氧化、抑制炎症和镇痛[2-4]等作用。本文以藏药翁布嫩枝叶为原料,优化了采用水蒸气蒸馏法提取翁布挥发油的提取工艺,运用