烟草花叶病毒RNA 3’-末端多聚腺苷酸化的研究

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众所周知,烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus, TMV)是一种典型的正链RNA病毒,其基因组3’-末端序列折叠构成类tRNA结构,而非poly(A)尾巴。与此传统认知不同,本研究揭示至少有一少部分TMV基因组RNA(gRNA)具有3’多聚腺苷酸尾巴。数据分析表明,大部分3’多聚腺苷酸序列并非直接添加于完整TMV gRNA的3’-末端,而是与3’-端核苷酸缺失的TMV gRNA分子相连接。同时,根据组成核苷酸,这类3’多聚腺苷酸序列可分为poly(A)和poly(A)-rich两大类,其中后者比例占优,且其分子特征与目前在生物界中己鉴定的具有促进RNA降解功能的3’-多聚腺苷酸序列基本一致。分子检测表明在叶绿体RNA中没有或者均有微量的具有poly(A)和poly(A)-rich尾巴的TMV RNA分子;利用VIGS沉默叶绿体多聚核苷酸磷酸化酶(polynucleotide phosphorylase, PNPase),一种特异生成3’poly(A)-rich序列的重要聚合酶,也没有影响TMV RNA的多聚腺苷酸化。由此推断,植物叶绿体不是TMV RNA发生多聚腺苷酸化的亚细胞位点。此外,基于多聚腺苷酸化的TMV RNA分子的发现,本研究进一步分析了其它不同科属、且普遍认定的缺乏3’poly(A)的正链RNA病毒,结果表明所有6种检测的病毒均具有连接poly(A)和poly(A)-rich尾巴的RNA分子。因此,这类此前未知的多聚腺苷酸化病毒RNA分子可能反映了一种普遍存在的病毒-寄主互作机制,值得深入研究。
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