钩虾属Gammarus隶属于端足目Amphipoda钩虾科Gammaridae,在欧亚大陆和北美均有分布,是甲壳动物中种类丰富度最高的属之一,迄今已有超过200种被文献报道。新疆位于欧亚大陆腹地,处于贝加尔湖和黑海-里海盆地两大淡水钩虾多样性最为丰富的地区之间,然而新疆地区有关钩虾的研究较少。由于时代的局限性,以前的研究主要是基于形态学方法开展的研究,在分子方面尚缺乏系统化的研究,且未将近些年发现的新种涵盖在内。因此,对新疆钩虾属进行系统的整理,并从分子水平开展分子系统学和生物地理学研究是有必要的。本研究系统总结了新疆钩虾属各物种的形态学特征及其地理分布,用线粒体基因（COI,16S）和核基因（18S,28S,EF1α）共5个基因片段构建了新疆钩虾属的系统发育树,对新疆钩虾属各物种的有效性进行了探讨,并重建了新疆钩虾属的祖先分布区,对新疆钩虾属的起源演化进行了研究,主要研究结果如下:1.详细描述了新种周氏钩虾Gammarus zhouqiongi sp.n.,对其结构特征图进行了绘制,并编制了新疆钩虾属的种类检索表。新疆钩虾属共计有9种,在南、北疆均有分布,集中分布在新疆西部的额尔齐斯河、额敏河和伊犁河等跨境河流中;2.除简毛钩虾G.simplex无分子数据不做分析外,基于线粒体基因COI基因对新疆钩虾属的种间和种内遗传距离的分析表明,新疆钩虾属的种间遗传为0.16-0.37,种内遗传距离为0.00-0.05。基于线粒体基因（COI,16S）和核基因（18S,28S,EF1α）的联合序列,用最大似然法和贝叶斯法构建的进化树均表明,新疆钩虾属内的8个物种都有着各自的分支,高度的单系性充分支持了物种的有效性;3.用联合基因构建的带分子钟的进化树表明,新疆钩虾属约在24 Ma首次出现分歧,10 Ma左右的中新世中晚期是新疆钩虾属成种的重要阶段,约8 Ma新疆钩虾属内的各物种均已形成,各钩虾物种的不同地理种群形成于2 Ma左右;4.祖先分布区重建的结果表明,准噶尔盆地、塔里木盆地、伊犁谷地和额敏盆地可能均为新疆钩虾属的共同祖先分布地。结合地质事件,推测青藏高原的第一次大隆起和巴拉特提斯海的消亡导致了部分钩虾的祖先向西扩散,新疆钩虾属首次出现分歧;青藏高原的第2、3次大隆起及伴随的巨大气候改变,促使新疆钩虾属内物种进一步分化,各物种在此时期基本形成;最后,青藏高原的第4次大隆起和第四纪大冰期,这两次地质事件促成了钩虾不同地理种群的形成。