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猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2, PCV2)感染主要引起断奶仔猪多系统衰竭综合症,还可引发肺炎,同时对猪的免疫系统产生影响,能诱导仔猪的免疫抑制。而猪肺泡巨噬细胞(porcine alveolar macrophage, PAM)不仅是猪圆环病毒2型的靶细胞,而且是一种重要的免疫细胞,具有抗原递呈、产生细胞因子、吞噬外来病原微生物的功能。因此,研究PCV2与猪肺泡巨噬细胞的互作以及PCV2感染PAM后的蛋白质组水平的变化,将有助于阐明PCV2的致病机理。本研究以猪肺泡巨噬细胞3D4／21细胞系为模型,通过对感染PCV2 WH株3D4／21细胞的比较蛋白质组学研究,试图从细胞和蛋白质水平探讨猪圆环病毒2型的致病机理。应用双向凝胶电泳结合质谱鉴定的方法,对PCV2感染的PAM细胞差异蛋白进行分析。数据分析显示,在PCV2感染PAM后的不同时间点,共有58个差异表达蛋白被发现,主要的差异表达蛋白出现在PAM感染后24-48h。经MALDI-TOF/TOF质谱分析,共成功的鉴定出32个差异表达蛋白,包括14个上调表达蛋白和18个下调表达蛋白。其中,PCV2感染PAM后24h上调蛋白有：醛脱氢酶9A1、前mRNA加工因子19、微丝相关蛋白,下调蛋白有：多聚腺苷酸结合蛋白、磷脂结合蛋白、含有EF-H结构域的蛋白D2、蛋白酶体激活复合物亚型1、蛋白酶体β亚基、热休克蛋白β-1；PCV2感染PAM后48h上调蛋白有：t-复合多肽1、分子伴侣Erp和Tapasin二聚体、谷氨酰胺酶、α-烯醇化酶、线粒体鸟氨酸氨基转移酶、Tar DNA结合蛋白、中间丝相关蛋白、酸性核蛋白体磷蛋白PO、微管蛋白、真核细胞起始因子5A、CLIC蛋白4,下调蛋白有：微丝相关蛋白、增殖细胞核抗原、中间丝相关蛋白、前mRNA剪接因子、天冬氨酸氨基转移酶、精氨酸酶、磷脂结合蛋白；PCV2感染PAM后96h下调蛋白有：微丝相关蛋白tropomyosin-3、14-3-3蛋白。这些差异蛋白主要涉及细胞骨架蛋白,生物大分子合成相关蛋白,能量代谢、应激蛋白,泛素蛋白酶体途径,信号转导和基因调控相关蛋白等。本研究通过蛋白质水平的动态变化,为进一步探索猪圆环病毒感染的致病机理,提供了丰富的理论基础。