骨髓增生异常综合征伴+8染色体异常患者51种基因突变的综合检测与分析

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目的通过对伴+8染色体异常的骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)患者51种基因的靶向检测及分析,探讨伴+8染色体异常的MDS患者基因突变特点及其临床和实验室特征,从而进一步了解其分子生物学机制,为其精确诊断和预后评估提供依据。方法回顾性分析2016年1月至2018年1月由苏大附一院血液科诊断并收住入院的122例MDS患者的临床、分子生物学和细胞遗传学特征;根据世界卫生组织2016年MDS分型系统对122例病例逐一分型;根据最新修订的国际预后评分系统(IPSS-R)对122例病例进行预后分层;分析+8染色体异常MDS患者51种基因二代靶向测序结果,分析其基因突变特点及其与临床资料的相关性。P<0.05为差异有统计学意义。结果1.通过对122例MDS患者51种基因的靶向检测,共发现39种基因突变,基因突变总数为243个。其中,有100例患者(81.9%)至少携带1种基因突变,每一例患者的突变基因个数在0-6个(Md=2)。常见的突变基因按照降序排列如下:U2AF1(31例,25.4%)、ASXL1(26例,21.3%)、RUNX1(19例,15.5%)、TET2(13例,10.6%)、NRAS(11例,9.0%)、DNMT3A(11例,9.0%)、BCOR(11例,9.0%)、SETBP1(10例,8.1%)、NPM1(9例,7.3%)、SRSF2(8例,6.5%)、CSMD1(8例,6.5%)、TP53(7例,5.7%)、SF3B1(7例,5.7%)。2.在27例+8染色体异常的MDS患者中,有24例存在至少1种基因突变。与非+8染色体异常患者相比,每例患者基因突变数没有统计学差异。在+8染色体异常的患者中RNA剪接因子相关基因突变发生率明显较高,而转录因子相关基因和酪氨酸受体基因突变发生率相对较低(P=0.001)。3.与非+8染色体组患者相比,U2AF1基因突变与+8染色体异常明显相关(χ2=15.206,P=0.001)。在+8染色体异常的患者中,U2AF1等位基因的平均变异频率(VAF)为41.24%(30.1%-47.1%),均为杂合突变。使用Mann-Whitney U检验判断+8染色体异常患者与非+8染色体异常患者的等位基因变异频率(VAF)是否有差异,结果显示+8异常组(平均秩次为19.80)与非+8异常组(平均秩次为12.44)的等位基因变异频率有统计学意义,U=63,Z=-2.253,P=0.024。4.在31例U2AF1基因突变患者的蛋白序列中,有17例第34位的丝氨酸被酪氨酸替代(S34Y),其中1例同时有第157位的谷氨酰胺被精氨酸替代(Q157R);有14例第34位的丝氨酸被苯丙氨酸替代(S34F)。本研究中,S34Y和S34F在+8染色体异常患者中所占比例与非+8异常的患者相当。5.以63例正常核型患者作为对照,分析27例+8染色体异常患者的临床特点。+8染色体异常组多系异常造血(MLD)的患者明显多于正常核型组,而原始细胞增多型(EB)患者相对较少(χ2=6.972,P<0.05)。同时,+8染色体异常组的骨髓原始细胞数(平均秩次为37.06)明显低于正常核型组(平均秩次为49.12)(U=622.5,Z=-2.036,P=0.042)。比较27例+8染色体异常患者中U2AF1基因突变与未突变患者的临床及实验室特征,两组患者在性别、年龄、WHO分型、骨髓原始细胞、IPSS-R预后评分等特征中均无明显统计学差异。结论伴有+8染色体异常的MDS患者有独特的分子学特征,接近90%的此类患者至少携带一种基因突变,突变发生率最高的基因为U2AF1,该基因突变与+8染色体异常核型有一定相关性,但与外周血细胞、骨髓原始细胞等临床及实验室特征无显著关联性。
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