KIAA2018在骨肉瘤中的作用及其调控miRNAs的鉴定

被引量 : 0次 | 上传用户:wodeking2009
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
骨肉瘤是一种以骨质破坏为特征的恶性肿瘤,是干细胞向成骨细胞分化过程中受遗传或表观遗传变化影响的一种分化缺陷疾病。Runx2是骨肉瘤原癌基因,在骨肉瘤细胞中Runx2介导的成骨分化是紊乱的。KIAA2018隶属于bHLH转录因子超家族,目前尚无文献报道该基因的功能。在人bHLH家族中,KIAA2018与C亚类中的AP-1亲缘关系最近,同属于E-Box调节因子。AP-1能通过Runx2 P1基础核心启动子上DNase敏感区域中的HLH/E-box(一种蛋白/DNA互作结构域),靶向调控骨肉瘤原癌基因Runx2的转录,此外,骨肉瘤中血管生成、骨肉瘤细胞迁移、侵袭、转移等过程所需的关键因子也都是其直接调控的下游基因。miRNA可通过碱基互补配对原则识别靶基因3’UTR上结合位点,在转录后水平以mRNA降解或抑制蛋白翻译的方式负调控靶基因,进而参与疾病发生等多种生理过程。哺乳动物中,大约90%的基因可受miRNA的调控。本研究的目的是:1)在人骨肉瘤Saos-2细胞中抑制KAA2018表达,研究其对骨肉瘤原癌基因Runx2转录的影响;2)鉴定调控KIAA2018的miRNAs;3)筛选KIAA20183’UTR区的miRNA相关SNP。方法1.通过shRNA慢病毒介导构建KIAA2018基因敲降型Saos-2细胞模型,qPCR检测对照组Saos-2细胞和KIAA2018敲降型Saos-2细胞中Runx2在mRNA水平上的差异。2.运用Diana-micro、miRanda、miRDB、PICTAR、PITA、RNA22、RNAhybrid、 Targetscan、miRWalk9种miRNA靶基因分析工具,预测可能调控人KIAA2018的miRNA,后运用荧光素酶报告基因法进行实验验证;之后,再进一步合成相应miRNA的模拟物和抑制剂转染293T细胞,利用qPCR检测内源性miR-27a的表达变化对KIAA2018的影响。3.首先运用miRNASNPv2.0、mrSNP和SNPinfo筛选KIAA20183’UTR区的miRNA相关SNP,然后对候选SNP分别构建插入野生型KIAA20183’UTR和突变型KIAA20183’UTR的psi-CHECK2重组表达载体以及插入相应pre-miRNA的pCMV-MIR重组载体,最后运用双荧光素酶报告基因法进行检测。结果1.利用PHBLV-U6-GFP-T2A-Puro慢病毒载体系统,成功构建了KIAA2018基因敲降型Saos-2细胞模型,qPCR结果显示与正常Saos-2细胞相比,KIAA2018基因敲降型Saos-2细胞中RUNX2的mRNA水平降低至约34%。2.运用Diana-micro、miRanda、miRDB、PICTAR、PITA、RNA22、RNAhybrid、 Targetscan和miRWalk分析KIAA2018基因,Diana-microT、miRanda、miRDB和TargetSacan显示KIAA2018可能受miR-27a、miR-96、miR-199a和miR-216a调控;而分析这4个miRNA可能的靶基因时,只有miR-27a的靶基因中含有KIAA2018。 TargetScan分析结果揭示miR-27a成熟序列中与KIAA2018作用的8个碱基在脊椎动物中高度保守。双荧光素酶报告基因检测证实miR-27a调控KIAA2018的表达。进一步检测miR-27a对内源性KIAA2018转录的影响,qPCR结果显示转染miR-27a mimics提高内源性miR-27a表达,引起KIAA2018 mRNA水平下调40.4%(p<0.01);而转染miR-27a inhibitor抑制内源性miR-27a表达,引起KIAA2018 mRNA水平上调39.8%(p<0.01)。3. KIAA2018 3’UTR区上的两个SNP rs9814605 (chr3:113372048, T/C)和SNPrs13065268 (chr3:113372047, G/A)能影响miR-513a-5p与KIAA2018的结合。当SNPrs9814605位点由T→C时,miR-513a-5p不能与KIAA2018结合(p<0.01);当SNPrs13065268位点由G→A时,miR-513a-5p不能与KIAA2018结合(p<0.01)。荧光素酶报告基因实验检测结果与预测一致,且发现当rs9814605为T等位基因,同时rs13065268为G等位基因时,它们共同引起的miR-513a-5p对KIAA2018的下调作用显著增强。结论1. KIAA2018可通过调控骨肉瘤原癌基因Runx2在骨肉瘤中发挥作用。2. miR-27a可能调控KIAA2018的表达与骨肉瘤相关联。3. KIAA2018 3’UTR的SNP rs9814605和SNPrs13065268能影响与骨肉瘤有关的miR-513a-5p与KIAA2018的结合。
其他文献
互联网的出现使人类的信息量骤增,内容丰富多样,并且变化频繁。在面对海量信息时,用户无法有效获取需要的内容,导致信息的使用率降低。解决这一问题的方法之一是,网站可用性
随着数字化信息技术的快速发展,各大高校逐渐重视新兴信息技术在管理和教学中的应用。使用新技术在高校中开展学生工作,已经成为高校提升工作技术含量,减少学校与学生间关系
在信息化和数字化的当今社会,大量的信息以数据的形式进行着传递和交流,要想获取数据里面的信息,就得对这些数据进行整理与分析,而分析数据的有利工具就是方式多样的统计图表
近年来,关于道德的研究开始将更多的注意力从道德推理转向道德自我,探究道德自我对道德行为的影响。有一部分研究发现,当个体认为自己是道德时,未来会做更少的道德行为;当个体
运用马尔科夫区制转移向量自回归(MS-VAR)模型再次对中国1978-2010年期间的能源消费与经济增长之间的关系进行的研究,相对于固定参数的VAR模型和VECM模型,该模型可以观测到两
青年是国家和社会建设的未来和希望,青年的政治社会化是推动政治发展和政治稳定的必然要求。当今社会,网络凭借其便捷性、高效性等优势对政治领域产生着重要影响,同时也激发
在英语听说读写四项基本技能中,阅读占有重要位置。阅读是一项综合技能,阅读能力的高低能够反映出英语学习者综合能力的高低。培养学生的阅读能力是我国高中阶段英语教学的重
农业技术的进步和应用,对提高农业生产效率,转变农业生产方式,调整农业生产结构,突破资源环境约束以及农业和农村经济的发展有着至关重要的作用。我国的农业科学技术研究已取
本文从信息技术经济学的角度,探讨了广义信息技术的概念;提出了软、硬信息技术的分类,列出了具体的软、硬信息技术组成;分析了信息技术软、硬分类的必要性。
以江泽民为核心的党的第三代领导集体提出的以德治国的治国方略,有其深远的文化根基,是对中国传统"德治"思想的合理概括和理论提升。分析中国古代德治思想,可以探寻出"以德治