当今社会,频繁发生的公共危机已成为世界各国在社会治理中必然面临的重大挑战,作为公共事务的管理者和公共服务的提供者,政府必然在公共危机管理中处于主体地位。但由于危机管理处置的实效性,技术的专业性以及主体的整合性等特征,使效率低下、成本昂贵、灵活性差的“全能型”政府难以适应危机管理的高效、快速、灵活、协调的要求。而非政府组织作为公民社会的重要组织实体,其所具有的专业优势、社会动员优势、行动优势以及特需满足优势能够弥补政府在公共危机管理中的不足。因此,整合政府与非政府组织的力量和资源,加强二者的协调与合作,对于转变政府职能、提高危机管理效率有重大意义。本文从我国公共危机管理的现实情况出发,首先从政府进行公共危机管理的不足和非政府组织参与公共危机管理的优势出发,利用市场／政府失灵理论、治理与善治理论、公民社会理论,分别分析了我国政府与非政府组织共同参与公共危机管理的理论必要性和现实可行性,然后以南方雪灾,“5·12”汶川地震以及玉树地震等为例,提出了我国公共危机管理中二者合作的各种问题,最后在借鉴国外发达国家经验的基础上,针对二者合作存在的问题,从合作领域、主体理念、互动沟通、制度保障以及社会环境方面,提出了加强二者合作的建议,希望充分发挥非政府组织在公共危机管理中的作用,在危机管理中实现政府与非政府组织的良好合作,提高危机管理的治理水平。