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风毛菊属(Saussurea DC.)是菊科菜蓟族最大的属之一，约460个种，呈典型北半球分布。前人的分子系统学研究结果表明该属传统的属下各分类单元大多不是单系，其属下划分需要更科学的分类系统。此外，风毛菊属的起源与演化及现代分布格局的成因不明。本文通过广泛的类群取样，利用分子系统学方法重建了风毛菊属的系统发育框架。同时，在所建立的系统发育框架基础上，重建了多个重要形态性状的进化历史，并利用分子钟估算和祖先分布区重建方法，探讨了风毛菊属的起源和演化历史。主要结果如下： 1.分子系统学研究 在充分考虑类群代表性和地理分布代表性的情况下，我们选取了风毛菊属植物共263种441样品及其近缘属7个属11个样品，进行了两次系统发育分析: (1)利用4个叶绿体基因片段(ycf1、rpl32-ndhF、psbA-trnH、trnL-F)和1个核核糖体基因(nrDNA)片段(ITS)对风毛菊属进行了初步的系统发育分析;(2)利用7个叶绿体基因片段(ycf1、rpl32-ndhF、psbA-trnH、trnL-F、rbcL、trn Y-rpoB、trnL-rpl32）和2个核核糖体基因片段(ITS和ETS)对部分代表物种进行了深入的系统发育分析。结果表明:(1)风毛菊属为支持率很强的单系，其姐妹类群为肉木香属(Polytaxis);(2)风毛菊属属下的传统分类等级大部分不是单系;(3)风毛菊属植物被重新划分为5个大的分支，但5个分支之间的关系尚不明确，有待更进一步的研究。 2.形态进化的重建 7个重要形态性状（头状花序排列方式，叶形，茎明显与否，茎是否有翼，总苞长宽比，总苞被毛情况，总苞片是否反折）的进化重建表明:这些通常用于风毛菊属的分类与鉴定的形态性状都是多次起源的，存在明显的趋同现象，不应作为风毛菊属属下各分类群之间的鉴别特征。 3.生物地理学研究 在建成的风毛菊属属下分类系统发育框架的基础上，利用BEAST进行了分子钟估算，利用RASP软件中的S-DIVA、DEC和S-DEC方法进行祖先分布区重建。结果表明，风毛菊属最近共同祖先起源于中新世晚期(约7.66Mya)的横断山地区，受青藏高原第三次抬升的影响，分化成海拔相对较高和相对较低的2支;受青藏高原第四次抬升的影响，风毛菊属在3.6Mya后发生了多次辐射进化;受全球气温降低的影响，风毛菊属在中新世晚期开始向青藏高原-横断山以外的高山扩散，并约在更新世扩散到北美洲。