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目的：耐药结核分枝杆菌的传播流行加剧了结核病的全球疫情，而且对脊柱结核也构成了严峻威胁。然迄今为止，国内外关于耐药脊柱结核的临床特征、耐药模式及原因、治疗及预后的报道较少。耐药脊柱结核容易引起初治失败或局部复发，因此早期诊断并采取合理的治疗方案至关重要。传统的基于分枝杆菌液体培养系统及改良罗氏绝对浓度法的药敏试验是诊断耐药结核的金标准，但其耗时较长，容易造成诊断延误。近年来，基因芯片技术被用于在结核分枝杆菌临床分离株或痰液标本中进行分枝杆菌菌种鉴定及MDR-TB检测，具有较高的敏感度和特异度，但其在脊柱结核临床标本中的应用尚未见报道。另外，随着MDR-TB及XDR-TB的日趋流行，对其它一线药物及二线药物耐药的结核病例也逐渐增多，而目前多数分子药敏检测方法只针对一线药物中的INH及RMP设计，因此亟需开发新的结核耐药快速检测方法，用于同时检测常用一线药物及二线药物的耐药性。因此，本研究拟分析耐药脊柱结核的临床特征、耐药表型及产生原因，并回顾性评价基于药敏试验的个体化化疗联合手术对耐药脊柱结核的临床疗效；此外，针对脊柱结核临床标本，采用晶芯DNA微阵列芯片行平行的分枝杆菌菌种鉴定及INH、RMP耐药基因突变检测，以验证该技术用于耐药脊柱结核诊断的可行性及准确性；最后，研发用于SM/EMB/LVFX/AMK/CPM等五种抗结核药物耐药基因突变检测的新型DNA微阵列芯片，对结核分枝杆菌临床分离株进行检验，并与表型药敏结果对照，以初步评价该技术的可行性及准确性。方法：1.回顾性分析2005年9月-2010年5月在第三军医大学西南医院骨科接受手术治疗，术后经病理学检查及药敏试验证实为耐药脊柱结核，且随访时间大于18月的35例患者。术后参考ATT史及药敏结果，行药敏试验指导下的个体化化疗。术后定期随访，观察各随访时相点的临床表现、影像学变化及实验室指标。分析其临床特征、耐药表型及既往ATT史，评价植骨融合情况、手术相关并发症及术后结核复发情况。2.自2009年3月-2011年12月，在第三军医大学西南医院骨科开展此项前瞻性验证性研究，共153例连续收治的、且经病理学及影像学检查确诊的脊柱结核患者被纳入本研究。术中获得病灶组织标本(如脓液、干酪样或肉芽组织)并分成两等份，一份行BACTEC MGIT960分枝杆菌液体培养系统快速培养，培养阳性者行改良罗氏绝对浓度法药敏试验；另一份采用晶芯基因芯片行分枝杆菌菌种鉴定及RMP、INH耐药相关基因rpoB、inhA及katG的突变检测。以表型药敏试验为金标准，评价基因芯片在脊柱结核临床标本中行分枝杆菌菌种鉴定及RMP、INH耐药检测的敏感度及特异度。3.自重庆市公共医疗救治中心检验科的结核分枝杆菌菌株库中，收集137株结核分枝杆菌临床分离株样本，其中包括111株耐药菌株及26株敏感菌株。设计并制备用于SM/EMB/LVFX/AMK/CPM耐药基因突变检测的DNA微阵列芯片，对137株临床分离株进行检测，并与表型药敏试验对照，评价基因芯片检测上述五种抗结核药物耐药性的可行性与准确性。结果：1.35例耐药脊柱结核患者包括初治病例22例(62%)，复治病例13例(38%)；MDR-TB12例，既往化疗平均持续14.50±2.00(0-60)月；非MDR-TB23例，既往化疗平均持续4.56±1.54(0-74)月；32例接受开放手术，3例接受微创置管灌洗局部化疗术；术后个体化化疗平均持续23.6(18-29)月；术后6例局部复发；末次随访时33例临床治愈，另外2例仍在进行化疗。2.采用晶芯基因芯片对153份脊柱结核临床标本行分枝杆菌菌种鉴定，结核分枝杆菌的鉴定阳性率为74.51%(114/153)。在培养阳性标本中，基因芯片结核分枝杆菌菌种鉴定的敏感度为93.55%(87/93)。另外，对涂阳、培养阳性标本及涂阴、培养阳性标本，基因芯片菌种鉴定的敏感度分别为97.4%及73.3%。在RMP耐药检测方面，基因芯片的敏感度为88.9%，特异度为90.7%。在INH耐药检测方面，基因芯片的敏感度为80.0%，特异度为91.0%。采用基因芯片行结核分枝杆菌菌种鉴定及耐药基因突变检测平均耗时5.8(4-9)小时。3.137株结核分枝杆菌临床分离株样本中，包括SM耐药菌株83株，SM敏感菌株54株；EMB耐药菌株63株，EMB敏感菌株74株；LVFX耐药菌株37株，LVFX敏感菌株100株；AMK耐药菌株50株，AMK敏感菌株87株；CPM耐药菌株29株，CPM敏感菌株108株。基因芯片检测SM耐药性的敏感度和特异度分别为90.36%及70.37%；检测EMB耐药性的敏感度和特异度分别为61.90%及58.11%；检测LVFX耐药性的敏感度和特异度分别为94.59%与58.00%；检测AMK/CPM耐药性的敏感度和特异度分别为60.34%与93.67%。结论：1.耐药结核分枝杆菌的传播流行、诊断延误及长期不规范化疗是导致耐药脊柱结核产生的主要原因；基于药敏试验的化疗联合手术的个体化治疗方案有助于尽早治愈结核病灶，解决并发症，并避免获得性耐药的产生。此外，传统药敏试验耗时较长，而耐药脊柱结核术后的局部复发率较高。2.晶芯基因芯片能准确地对脊柱结核临床标本行结核分枝杆菌菌种鉴定及RMP、INH耐药检测。其操作简便、耗时较短。3.在SM与LVFX的耐药性检测方面，基因芯片具有较高的敏感度，但基因芯片检测EMB与LVFX耐药结核的特异度较低。在EMB、AMK/CPM耐药性检方面，基因芯片的敏感度均较低。