插入/缺失影响酵母有丝分裂重组率的研究

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比较基因组学的研究表明:同源染色体之间基因序列并非完全对称,其中一个典型的表现就是两条同源染色体之间存在插入/缺失(insertion and deletion,indel),这种非对称的DNA结构存在特殊的遗传规律。在很多基因组中核苷酸多态性的分布并不是随机的,同种生物不同个体之间在同一个基因座位置常常存在相互不同的单倍型(haplotype)。有研究对自交物种拟南芥基因组中插入/缺失周围区域核苷酸多态性研究发现,插入/缺失临近DNA序列通常被分为两组,分别与插入或缺失的存在相对应,即与插入/缺失相联系的核苷酸二态性(indel-associated nucleotide dimorphism),及核苷酸差异度与距插入/缺失的距离呈负相关这一规律。插入/缺失的存在可能抑制周围序列的重组,同源染色体之间重组事件的抑制而产生的分子隔离,使得插入/缺失周围的核苷酸差异得以保留下来。   “插入/缺失产生分子隔离”假说的基础在于插入/缺失对重组的抑制作用。为此我们以酿酒酵母(S.cerevisiae)为材料,选择HIS3和URA3为标记基因,设计了一系列插入/缺失结构的新品系,直接比较插入/缺失的存在与否以及插入/缺失的大小对酵母有丝分裂重组率的影响。通过波动分析和中值法分析实验结果,发现重组率与插入/缺失大小呈负相关,染色体内重组以及同源染色体间的重组事件都随着插入/缺失的增大而不断减小。
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