基于数字信号处理方法的基因预测

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基因是指携带有遗传信息的DNA或RNA序列,也称为遗传因子,是控制性状的基本遗传单位。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表现。基因预测是基因表达、基因调控、蛋白质结构预测、生物医学工程研究的基础,以基因预测为基础的研究最终将用来解释包括进化在内的其他各种生命过程和生命现象,可以说,基因预测是后基因组时代研究的基础。本文运用数字信处理的方法来对基因进行预测。首先本文基于基因外显子周期3特性,运用滑动窗法对基因预测的基本原理进行了分析,并仿真得到了预测曲线,总结并提出外显子的长度和周期性是影响预测结果的重要因素。其次,预测基因序列的同时,提出了一种预测基因外显子位置的快速算法,对于滑动DFT算法,提出了新的证明方法,对Goertzel算法进行了详细的推导,并运用这三种算法对基因序列进行仿真预测和比较。然后,针对背景噪声的问题,需要选通性较好滤波器进行预测,对陷波滤波器和多级滤波器的实现进行了详尽的推导,并对基因序列进行滤波,得到较好的基因预测曲线。最后,为了进一步抑制背景噪声,更好地预测基因序列F56F11.4a中的第一个外显子,运用频率抽样法设计了FIR窄带带通数字滤波器,对基因序列滤波,得到了较为理想的预测效果。
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