目的：探讨特定基因型白色念珠菌感染与口腔扁平苔藓的相关性,比较口腔扁平苔藓白色念珠菌随机引物扩增多态性DNA分析(random amplified polymorphic DNA, RAPD)和PCR internal transcribed spacer regionland 2(以下简称PCR ITS1-ITS2)序列测定,以期确立一种对口腔念珠菌可靠、准确的基因分型法,为临床治疗提供依据。方法：采用无菌棉捻拭子法从12例糜烂型扁平苔藓和36例非糜烂型扁平苔藓患者口腔黏膜病变处采集标本,28例口腔健康者的含漱液作为对照组。标本经分离取典型菌落用沙保劳氏琼脂平板培养,经表型鉴定有12株白色念珠菌菌株。然后分别采用RAPD和PCR ITS1-ITS2两种方法进行基因分型,比较分析两组患者与健康者念珠菌的基因同源性。结果：(1)口腔扁平苔藓患者白色念珠菌阳性率明显高于对照组,非糜烂组培养阳性率最高,与对照组及糜烂组有显著差异(P<0.05);对照组与糜烂组念珠菌培养阳性率也具有统计学差异(P<0.05)。(2) PCR ITS1-ITS2和RAPD结果具有一致性,对照组、非糜烂组及糜烂组组间白色念珠菌的基因型各不相同,对照组和糜烂组内各存在一种ITS基因型,而非糜烂组组内存在两种不同的ITS基因型。通过PCR ITS1-ITS2分析,将对照组和糜烂组白念菌的基因型分别定义为Ⅰ型和Ⅱ型,非糜烂组的两种基因型则为Ⅲa和Ⅲb型。结论：口腔扁平苔藓白念珠菌菌株间存在基因多态性；ITS1-ITS2序列Ⅱ、Ⅲa和Ⅲb基因型的白色念珠菌感染与口腔扁平苔藓存在相关性。