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随着我国草莓产业的迅速发展,草莓种植面积与产量居全球之首,在草莓栽培过程中各类病害随之而来。草莓属植物中的内生与附生细菌是抗病、促生益生菌的重要来源,因此,明确草莓属植物微生物组的分布特征及获得菌种资源对草莓属植物促生和防病机制研究工作的开展尤为重要。目前,针对草莓属植物所有器官及其微生物组的相关报道相对较少,有待开展深入、系统的相关工作。因此,本研究采用免培养的方法对云南野生种黄毛草莓(Fragaria nilgerrensis Schlecht)和栽培品种章姬(Akihime)八个部位(非根际土壤、根际土壤、根部表面、茎部表面、叶部表面、根部内生、茎部内生、叶部内生)的微生物群落的组成和结构进行系统的研究,分析黄毛草莓和章姬微生物组(原核生物和真菌)分布特征与环境因子的相关性;采用纯培养的方法,对黄毛草莓和章姬六个部位(根部表面、茎表面、叶表面、根部内生、茎内生、叶内生)的细菌进行分离与分子鉴定,分析黄毛草莓和章姬可培养细菌多样性。全文主要结论如下。1.原核生物群落的免培养方法研究结果显示:24个黄毛草莓样本共检测到26个门、60个纲、141个目、225个科、404个属、693个种和1136个OTU,变形菌门(Proteobacteria)为八个部位的优势类群;在属水平上,鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)和新鞘脂菌属(Novosphingobium)为八个部位共有的类群,八个部位的原核生物群落组成在属水平上存在显著的差异,优势类群分别为肠杆菌属(Enterobacter)、鞘脂单胞菌属、泛菌属(Pantoea)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和假单胞菌属(Pseudomonas)。24个章姬样品共检测到30个门、78个纲、171个目、261个科、492个属、815个种和1461个OTU,变形菌门为八个部位的优势类群;在属水平上,马赛菌属(Massilia)和鞘脂单胞菌属为八个部位共有的类群,八个部位的原核生物群落的组成在属水平上存在显著的差异,优势类群分别为节杆菌属(Arthrobacter)、泛菌属和假单胞菌属。对黄毛草莓和章姬相同部位的原核生物群落进行比较,黄毛草莓与章姬原核生物群落的多样性与丰富度存在显著的差异,新鞘脂菌属、泛菌属、Candidatus_Solibacter、鞘脂单胞菌属、RB41、不动杆菌属(Acinetobacter)、假单胞菌属、肠杆菌属、链霉菌属(Streptomyces)等是影响黄毛草莓和章姬样品相同部位出现差异的关键类群。在黄毛草莓和章姬样品中检测到两个古菌门,分别为Thermoplasmatota和泉古菌门(Crenarchaeota),且占比较少。黄毛草莓和章姬不同部位的原核生物群落受不同的土壤理化因子影响,且差异显著(P<0.05)。2.真菌群落的免培养方法研究结果显示:24个黄毛草莓样本中检测到16个门、62个纲、169个目、429个科、1077个属和1744个种和4739个OTU,在非根际土壤、根际土壤和根茎叶的表际,子囊菌门(Ascomycota)为优势类群;土壤、植物表际和植物内际的真菌群落的组成上在属水平存在显著的差异,植物表际中Pilidium和枝孢属(Cladosporium)的含量较高,螺旋聚孢霉属(Clonostachys)在非根际土壤中的占比较高。24个章姬样品检测到14个门、50个纲、130个目、298个科、633个属、934个种和1794个OTU,子囊菌门(Ascomycota)为八个部位的优势类群;在属水平上,葡萄孢属(Botrytis)、镰刀菌属(Fusarium)和Vishniacozyma分布于土壤和植物表际样品中。对两个样品相同部位的真菌群落进行比较,黄毛草莓与章姬真菌群落的多样性与丰富度存在显著的差异,Clonostachys、Podospora、镰刀菌属、葡萄孢属、毛壳菌属(Chaetomium)、Apodus、被孢霉属(Mortierella)、赤霉菌属(Gibberella)、红酵母属(Rhodotorula)、Articulospora和Stagonospora是影响黄毛草莓和章姬样品相同部位出现差异的关键类群;黄毛草莓和章姬不同部位的真菌群落受不同的土壤理化因子影响,且差异显著(P<0.05)。3.采用ISP5、高氏1号、R2A、植物培养基对黄毛草莓和章姬六个部位的细菌进行分离,从黄毛草莓根、茎、叶的内际和表际分离到515株细菌,归属于变形菌门(占72.04%)、拟杆菌门(Bacteroidetes)(占24.47%)和放线菌门(Actinobacteria)(占3.50%)中的6个纲、14个目、24个科、55个属,甲基杆菌属(Methylobacterium)、根瘤菌属(Rhizobium)、Novosphingobium和假单胞菌属为六个部位共有的类群;在属水平上,根部表面样品的优势类群为微杆菌属(Microbacterium),茎部和叶部表面样品为甲基杆菌属,叶部表面样品为甲基杆菌属和微杆菌属,根部内生样品为根瘤菌属,茎部和叶部内生样品为假单胞菌属。从章姬的根、茎、叶的表际和内际分离到495株细菌,归属于变形菌门(占41.62%)、拟杆菌门(占4.65%)、厚壁菌门(Firmicutes)(占3.23%)和放线菌门(占50.51%)中的7个纲、18个目、31个科、61个属,微杆菌属(Microbacterium)、链霉菌属(Streptomyces)、农杆菌属(Agrobacterium)和假单胞菌属为6个部位所共有的类群,根部表面样品的优势类群为节杆菌属(Arthrobacter),茎部表面样品为假单胞菌属和甲基杆菌属,叶部表面和叶部内生样品为微杆菌属,根部内生样品和茎部内生样品为链霉菌属。从黄毛草莓分离到22个潜在新类群,分别归属于Herbiconiux、新鞘脂菌属、不粘柄菌属(Asticcacaulis)、土地杆菌属(Pedobacter)、异根瘤菌属(Allorhizobium)、黏液杆菌属(Mucilaginibacter)、Pelomonas、杜擀氏菌属(Duganella)、农杆菌属和甲基杆菌属,占总菌株的5.27%;章姬中获得7个,分别归属于Planctomonas、金黄杆菌属(Chryseobacterium)、黄杆菌属(Flavobacterium)和假单胞菌属,占总菌株的1.41%。4.对免培养和纯培养方法获得的细菌群落进行比较分析,发现两种方法检测到的类群存在明显的差异,在门水平上,变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和厚壁菌门在两种方法中都能被检测到;在属水平上,通过与免培养方法检测到黄毛草莓和章姬不同部位中已知归属地位的类群比较,纯培养方法只分离到其5.69~77.15%的类群。通过开展上述研究,一方面揭示了黄毛草莓和章姬的微生物群落的多样性及其与环境非生物因子的相关性,并初步分析了其可培养细菌多样性;另一方面,为草莓抗病、促生益生菌的筛选、开发与利用提供了宝贵的菌种资源。因此,本论文的研究结果对草莓生态种植及产业的可持续发展具有较为重要的理论与现实意义。