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目的:了解中山神湾港地区鼠形动物的种类构成、密度、季节消长、体表携带寄生虫及鼠体感染鼠源性疾病病原体情况,确定神湾港口岸鼠形动物携带病原体的基因类型和变异关系,为防控鼠传疾病的传播提供重要的数据支持。使用DNA条形码技术对鼠形动物及其体表寄生虫进行鉴定,获得该地区鼠形动物及其体表寄生虫的DNA条形码信息。方法:2017年5月-2018年6月,在神湾货运码头区及神湾游艇码头区两个监测地点,采用笼夜法捕获鼠形动物,梳刷法采集鼠体表寄生虫,进行分类及形态鉴定,同时利用DNA条形码技术进行鉴定。解剖取鼠肺、肝、脾和肾脏组织,提取鼠肺RNA及肝、脾、肾DNA,采用核酸检测方法检测7种病原微生物的携带情况,同时对阳性样品PCR产物测序及系统进化分析。结果:1.神湾港鼠形动物监测结果:共捕获鼠形动物69只,分别隶属于2目2科3属3种,臭鼩鼱58只,占84.05%,为优势种群;平均鼠密度为3.89%,鼠密度季节消长明显(0.70%~7.14%),密度高峰期出现在7-8月份及3-4月份。2.鼠形动物体表携带寄生虫情况:鼠形动物体表检出吸虱12只、适存病蚤(Nosopsyllus nicanus)2只、粒形硬蜱(lxodes granulatus)95只、螨151只,其中毒厉螨(Laelaps echidninus)3只、地里纤恙螨(Leptotrombidium deliense)148只。鼠形动物染虱率、染蚤率、染蜱率、染螨率分别为2.90%(2/69)、1.45%(1/69)、20.29%(14/69)、4.35%(3/69)。3.鼠形动物病原微生物检出情况:汉坦病毒阳性2份,阳性率为2.90%(2/69),基因分型均为汉城病毒;致病性钩端螺旋体阳性3份,阳性率为4.35%(3/69)。遗传进化分析显示存在问号钩端螺旋体Leptospira interrogans及博氏钩端螺旋体L.borgpetersenii两种基因型;巴尔通体核酸阳性鼠样8份,阳性率为11.59%(8/69),遗传进化分析显示存在部族(野鼠)巴尔通氏体Bartonella tribocorum及B.sp.两种基因型。检出一只鼠形动物复合感染汉坦病毒、巴尔通体、钩端螺旋体,阳性率为1.45%(1/69)。土拉弗朗西斯菌、鼠疫耶尔森菌、恙虫病东方体、伯氏疏螺旋体核酸检测为阴性。4.DNA条形码鉴定结果:利用DNA条形码技术成功扩增了69只鼠形动物的69条COI基因序列,并成功鉴定出鼠形动物种类。构建NJ进化树,3个鼠种能单独分为一个分支,从而将不同属种的物种区分开来。DNA条形码技术成功扩增鼠体表寄生虫的COI片段,获得相应的DNA条形码序列。结论:1.神湾港口岸地区鼠密度较高,全年鼠密度波动较大,应加强灭鼠工作;2.鼠形动物检出在蜱、螨、蚤、虱类寄生虫,其中鼠体染蜱现象普遍,应当加强防控相关传染病的传播;3.神湾港口岸鼠形动物中存在汉坦病毒、致病性钩端螺旋体、巴尔通体感染,其基因型对人类具有致病性,存在人群感染的风险,疾病的人群流行情况需做深入的调查研究;4.对鼠形动物COI基因进行序列比对、遗传距离分析及序列聚类分析能准确快速进行分类和鉴定,DNA条形码技术能够纠正现场形态鉴定的偏差。该方法亦能应用到鼠形动物携带体表寄生虫的鉴定当中。