目的:通过对大肠癌细胞系及正常组织进行实验,我们分析了其MLH1基因内从启动子到第一内含子区域(含启动子、第一外显子及第一内含子中的Alu序列)甲基化的具体情况,并进一步分析其产生的可能原因,为进一步的实验提供依据。方法:选择RKO、SW48两个大肠癌细胞系作为实验样本,正常的大肠组织和人外周血液样本作为实验对照。提取DNA后重亚硫酸亚处理并进行BSP( Bisulfate-sequencing PCR ,亚硫酸氢盐修饰后测序法PCR )和MSP(Methylation-specific PCR,甲基化特异性PCR)。将PCR产物或者克隆产物测序,对测序结果进行分析比较。结果:大肠癌细胞系启动子区域的甲基化程度很高,而正常对照组织在此区域是非甲基化的;大肠癌细胞系第一内含子内Alu序列的甲基化程度相较于正常组织有所降低;位于启动子与内含子之间的区域里,大肠癌细胞系发生较高程度的甲基化,而正常组织是非甲基化的,且只局限在临近第一个Alu序列的几个CpG位点有甲基化发生。结论:大肠癌细胞系启动子区域的高度甲基化可能是由其Alu序列传递过来的。