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本研究从中国南海硇洲岛潮汐带采集栉江珧（Atrina pectinata）样品，采用纯培养法（culture-dependent method）和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析法（phylogenetic analysis）对样品中可培养细菌（含放线菌）的类群多样性、物种多样性和遗传多样性进行研究，采用琼脂扩散法对分离菌株进行抗菌活性筛选，并采用多相分类技术对部分代表潜在新类群（物种）菌株进行系统分类学研究研究，为进一步保护和利用该类微生物资源提供实验数据和理论指导。采用补充0–25%(w/v)氯化钠的MA、MH和NA培养基从栉江珧样品中分离到125株细菌，选取90个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育多样性分析。研究表明，这90个分离菌株分属于3个门（Gamma-Proteobacteria,Firmicutes, Actinobacteria）、6个科、10个属，可分为33个物种。优势类群为Firmicutes门（56株，62.2%）和Gamma-Proteobacteria亚门（31株，34.5%）。至少有5株可能代表新的分类单元（potential new taxa）。其中菌株JSM112024可能代表了Halomonadaceae科的一个属一级新分类单元；菌株JSM112019、JSM114045、JSM114058和JSM114083可能分别代表Salinivibrio、Bacillus、Halomonas和Virgibacillus属的新物种。采用8种敏感指示菌，利用琼脂扩散实验方法进行抗菌活性筛选，对生物活性的菌株进行系统发育分析和生物学特征观察。结果显示，125个分离菌株中，有18株的发酵液具有抗菌活性，占受试菌种总数的14.4%，其中6株（JSM112006，JSM114095，JSM114060，JSM112019，JSM114054，JSM114093）具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，这些活性菌株类群多样性较高，分属于4个属：菌株JSM112006属于Marinobacter属；JSM114095属于Halomonas属；JSM114060和JSM112019属于Salinivibrio属；JSM114054和JSM114093属于Staphylococcus属。采用生理生化、化学分类学、系统发育分析和分子分类特征方法对菌株JSM114083T进行研究，确定其代表枝芽孢杆菌属(Virgibacillus)的新种。为了确立JSM114083T菌株的精确分类地位，将这种新的分离菌株与Virgibacillus halodenitrificans,Virgibacillus necropolis和Virgibacillus carmonensis进行了DNA–DNA杂交，他们的DNA–DNA相关水平分别为19.5±3.2，10.3±2.1和11.8±2.5%，远低于Wayne等(1987)提出的用于归类菌株至相同物种的临界值70%。因此,根据这里提出的多种分类学数据，JSM114083T菌株应该代表Virgibacillus属的一个新种，我们提出命名为海洋枝芽孢杆菌（Virgibacillus marinus sp. nov）。综上研究结果表明，湛江硇洲岛潮汐带栉江珧中具有较丰富的细菌多样性，具有一定数量的抗菌菌种，并且还有着新的微生物种群（物种）。